Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q71RC1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q71RC1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q71RC1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Q71RC1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q71RC1 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q71RC1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Q71RC1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q71RC1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q71RC1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q71RC1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q71RC1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Q71RC1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q71RC1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q71RC1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q71RC1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q71RC1 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Q71RC1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q71RC1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q71RC1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q71RC1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q71RC1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q71RC1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q71RC1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q71RC1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Q71RC1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q71RC1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q71RC1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q71RC1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q71RC1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q71RC1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q71RC1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q71RC1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q71RC1 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q71RC1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q71RC1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q71RC1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Q71RC1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q71RC1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Q71RC1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q71RC1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Q71RC1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Q71RC1 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q71RC1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q71RC1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q71RC1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q71RC1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q71RC1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q71RC1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q71RC1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q71RC1 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q71RC1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q71RC1 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q71RC1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q71RC1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q71RC1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q71RC1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q71RC1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q71RC1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q71RC1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q71RC1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q71RC1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q71RC1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q71RC1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q71RC1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q71RC1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q71RC1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q71RC1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q71RC1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q71RC1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q71RC1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q71RC1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Q71RC1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q71RC1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q71RC1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q71RC1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q71RC1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q71RC1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q71RC1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q71RC1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q71RC1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q71RC1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Q71RC1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Q71RC1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Q71RC1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Q71RC1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q71RC1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q71RC1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q71RC1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Q71RC1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q71RC1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Q71RC1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Q71RC1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q71RC1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q71RC1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q71RC1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Q71RC1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Q71RC1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q71RC1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Q71RC1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms