Protein–RNA interactions for Protein: Q71F56

MED13L, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13-like, humanhuman

Predictions only

Length 2,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13LQ71F56 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MED13LQ71F56 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MED13LQ71F56 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MED13LQ71F56 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MED13LQ71F56 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MED13LQ71F56 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MED13LQ71F56 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MED13LQ71F56 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MED13LQ71F56 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MED13LQ71F56 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MED13LQ71F56 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MED13LQ71F56 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MED13LQ71F56 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MED13LQ71F56 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MED13LQ71F56 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MED13LQ71F56 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MED13LQ71F56 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MED13LQ71F56 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MED13LQ71F56 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MED13LQ71F56 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
MED13LQ71F56 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MED13LQ71F56 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MED13LQ71F56 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MED13LQ71F56 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MED13LQ71F56 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MED13LQ71F56 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MED13LQ71F56 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MED13LQ71F56 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MED13LQ71F56 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MED13LQ71F56 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MED13LQ71F56 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MED13LQ71F56 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MED13LQ71F56 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MED13LQ71F56 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MED13LQ71F56 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MED13LQ71F56 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MED13LQ71F56 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MED13LQ71F56 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MED13LQ71F56 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MED13LQ71F56 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MED13LQ71F56 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MED13LQ71F56 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MED13LQ71F56 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MED13LQ71F56 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MED13LQ71F56 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MED13LQ71F56 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MED13LQ71F56 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MED13LQ71F56 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MED13LQ71F56 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MED13LQ71F56 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MED13LQ71F56 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MED13LQ71F56 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MED13LQ71F56 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MED13LQ71F56 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MED13LQ71F56 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MED13LQ71F56 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MED13LQ71F56 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MED13LQ71F56 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MED13LQ71F56 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MED13LQ71F56 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MED13LQ71F56 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MED13LQ71F56 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MED13LQ71F56 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MED13LQ71F56 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MED13LQ71F56 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MED13LQ71F56 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MED13LQ71F56 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MED13LQ71F56 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MED13LQ71F56 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MED13LQ71F56 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MED13LQ71F56 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MED13LQ71F56 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
MED13LQ71F56 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MED13LQ71F56 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MED13LQ71F56 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MED13LQ71F56 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MED13LQ71F56 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MED13LQ71F56 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MED13LQ71F56 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MED13LQ71F56 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MED13LQ71F56 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MED13LQ71F56 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MED13LQ71F56 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MED13LQ71F56 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MED13LQ71F56 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
MED13LQ71F56 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MED13LQ71F56 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MED13LQ71F56 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MED13LQ71F56 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MED13LQ71F56 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MED13LQ71F56 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MED13LQ71F56 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MED13LQ71F56 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MED13LQ71F56 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MED13LQ71F56 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MED13LQ71F56 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MED13LQ71F56 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MED13LQ71F56 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MED13LQ71F56 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MED13LQ71F56 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms