Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUT9

DENND5B, DENN domain-containing protein 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND5BQ6ZUT9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
DENND5BQ6ZUT9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
DENND5BQ6ZUT9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
DENND5BQ6ZUT9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
DENND5BQ6ZUT9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
DENND5BQ6ZUT9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
DENND5BQ6ZUT9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
DENND5BQ6ZUT9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
DENND5BQ6ZUT9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
DENND5BQ6ZUT9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
DENND5BQ6ZUT9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
DENND5BQ6ZUT9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
DENND5BQ6ZUT9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
DENND5BQ6ZUT9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
DENND5BQ6ZUT9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
DENND5BQ6ZUT9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
DENND5BQ6ZUT9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
DENND5BQ6ZUT9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
DENND5BQ6ZUT9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
DENND5BQ6ZUT9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
DENND5BQ6ZUT9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
DENND5BQ6ZUT9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
DENND5BQ6ZUT9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
DENND5BQ6ZUT9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
DENND5BQ6ZUT9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
DENND5BQ6ZUT9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DENND5BQ6ZUT9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DENND5BQ6ZUT9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DENND5BQ6ZUT9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DENND5BQ6ZUT9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DENND5BQ6ZUT9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
DENND5BQ6ZUT9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
DENND5BQ6ZUT9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DENND5BQ6ZUT9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DENND5BQ6ZUT9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DENND5BQ6ZUT9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
DENND5BQ6ZUT9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DENND5BQ6ZUT9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
DENND5BQ6ZUT9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DENND5BQ6ZUT9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
DENND5BQ6ZUT9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DENND5BQ6ZUT9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
DENND5BQ6ZUT9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
DENND5BQ6ZUT9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
DENND5BQ6ZUT9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
DENND5BQ6ZUT9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
DENND5BQ6ZUT9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
DENND5BQ6ZUT9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DENND5BQ6ZUT9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
DENND5BQ6ZUT9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
DENND5BQ6ZUT9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
DENND5BQ6ZUT9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DENND5BQ6ZUT9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
DENND5BQ6ZUT9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
DENND5BQ6ZUT9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
DENND5BQ6ZUT9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
DENND5BQ6ZUT9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DENND5BQ6ZUT9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DENND5BQ6ZUT9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DENND5BQ6ZUT9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DENND5BQ6ZUT9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DENND5BQ6ZUT9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DENND5BQ6ZUT9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DENND5BQ6ZUT9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DENND5BQ6ZUT9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DENND5BQ6ZUT9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DENND5BQ6ZUT9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DENND5BQ6ZUT9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
DENND5BQ6ZUT9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
DENND5BQ6ZUT9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
DENND5BQ6ZUT9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DENND5BQ6ZUT9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DENND5BQ6ZUT9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DENND5BQ6ZUT9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DENND5BQ6ZUT9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DENND5BQ6ZUT9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DENND5BQ6ZUT9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DENND5BQ6ZUT9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DENND5BQ6ZUT9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DENND5BQ6ZUT9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DENND5BQ6ZUT9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DENND5BQ6ZUT9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DENND5BQ6ZUT9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DENND5BQ6ZUT9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DENND5BQ6ZUT9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DENND5BQ6ZUT9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DENND5BQ6ZUT9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DENND5BQ6ZUT9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DENND5BQ6ZUT9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DENND5BQ6ZUT9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DENND5BQ6ZUT9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DENND5BQ6ZUT9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
DENND5BQ6ZUT9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
DENND5BQ6ZUT9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DENND5BQ6ZUT9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DENND5BQ6ZUT9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DENND5BQ6ZUT9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DENND5BQ6ZUT9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DENND5BQ6ZUT9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
DENND5BQ6ZUT9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms