Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX46

ALKAL2, ALK and LTK ligand 2, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKAL2Q6UX46 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALKAL2Q6UX46 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALKAL2Q6UX46 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ALKAL2Q6UX46 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALKAL2Q6UX46 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALKAL2Q6UX46 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALKAL2Q6UX46 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ALKAL2Q6UX46 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALKAL2Q6UX46 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALKAL2Q6UX46 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ALKAL2Q6UX46 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALKAL2Q6UX46 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ALKAL2Q6UX46 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
ALKAL2Q6UX46 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALKAL2Q6UX46 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ALKAL2Q6UX46 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALKAL2Q6UX46 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALKAL2Q6UX46 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALKAL2Q6UX46 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALKAL2Q6UX46 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALKAL2Q6UX46 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALKAL2Q6UX46 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALKAL2Q6UX46 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALKAL2Q6UX46 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALKAL2Q6UX46 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALKAL2Q6UX46 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALKAL2Q6UX46 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALKAL2Q6UX46 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALKAL2Q6UX46 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALKAL2Q6UX46 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALKAL2Q6UX46 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALKAL2Q6UX46 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALKAL2Q6UX46 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALKAL2Q6UX46 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALKAL2Q6UX46 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALKAL2Q6UX46 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALKAL2Q6UX46 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALKAL2Q6UX46 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALKAL2Q6UX46 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALKAL2Q6UX46 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALKAL2Q6UX46 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALKAL2Q6UX46 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALKAL2Q6UX46 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALKAL2Q6UX46 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALKAL2Q6UX46 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALKAL2Q6UX46 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALKAL2Q6UX46 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALKAL2Q6UX46 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALKAL2Q6UX46 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALKAL2Q6UX46 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALKAL2Q6UX46 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALKAL2Q6UX46 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALKAL2Q6UX46 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALKAL2Q6UX46 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALKAL2Q6UX46 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALKAL2Q6UX46 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALKAL2Q6UX46 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALKAL2Q6UX46 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALKAL2Q6UX46 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALKAL2Q6UX46 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALKAL2Q6UX46 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALKAL2Q6UX46 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ALKAL2Q6UX46 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALKAL2Q6UX46 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALKAL2Q6UX46 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ALKAL2Q6UX46 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALKAL2Q6UX46 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALKAL2Q6UX46 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALKAL2Q6UX46 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALKAL2Q6UX46 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALKAL2Q6UX46 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALKAL2Q6UX46 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALKAL2Q6UX46 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALKAL2Q6UX46 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALKAL2Q6UX46 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALKAL2Q6UX46 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALKAL2Q6UX46 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALKAL2Q6UX46 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALKAL2Q6UX46 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALKAL2Q6UX46 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALKAL2Q6UX46 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALKAL2Q6UX46 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALKAL2Q6UX46 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALKAL2Q6UX46 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALKAL2Q6UX46 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALKAL2Q6UX46 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALKAL2Q6UX46 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALKAL2Q6UX46 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALKAL2Q6UX46 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ALKAL2Q6UX46 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALKAL2Q6UX46 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALKAL2Q6UX46 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALKAL2Q6UX46 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALKAL2Q6UX46 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALKAL2Q6UX46 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALKAL2Q6UX46 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALKAL2Q6UX46 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALKAL2Q6UX46 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALKAL2Q6UX46 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALKAL2Q6UX46 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms