Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY1

TMEM88, Transmembrane protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM88Q6PEY1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM88Q6PEY1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM88Q6PEY1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM88Q6PEY1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM88Q6PEY1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM88Q6PEY1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM88Q6PEY1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM88Q6PEY1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM88Q6PEY1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM88Q6PEY1 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TMEM88Q6PEY1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TMEM88Q6PEY1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM88Q6PEY1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM88Q6PEY1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM88Q6PEY1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM88Q6PEY1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM88Q6PEY1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM88Q6PEY1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM88Q6PEY1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM88Q6PEY1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM88Q6PEY1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM88Q6PEY1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM88Q6PEY1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM88Q6PEY1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM88Q6PEY1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM88Q6PEY1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM88Q6PEY1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM88Q6PEY1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM88Q6PEY1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM88Q6PEY1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM88Q6PEY1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM88Q6PEY1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM88Q6PEY1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM88Q6PEY1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM88Q6PEY1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM88Q6PEY1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM88Q6PEY1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM88Q6PEY1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM88Q6PEY1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM88Q6PEY1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM88Q6PEY1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM88Q6PEY1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM88Q6PEY1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM88Q6PEY1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM88Q6PEY1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM88Q6PEY1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM88Q6PEY1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM88Q6PEY1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM88Q6PEY1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM88Q6PEY1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM88Q6PEY1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM88Q6PEY1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM88Q6PEY1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM88Q6PEY1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM88Q6PEY1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM88Q6PEY1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM88Q6PEY1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM88Q6PEY1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMEM88Q6PEY1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMEM88Q6PEY1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM88Q6PEY1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM88Q6PEY1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM88Q6PEY1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM88Q6PEY1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM88Q6PEY1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM88Q6PEY1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM88Q6PEY1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM88Q6PEY1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM88Q6PEY1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM88Q6PEY1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM88Q6PEY1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM88Q6PEY1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM88Q6PEY1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM88Q6PEY1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM88Q6PEY1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM88Q6PEY1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM88Q6PEY1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM88Q6PEY1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM88Q6PEY1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM88Q6PEY1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM88Q6PEY1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM88Q6PEY1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM88Q6PEY1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM88Q6PEY1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM88Q6PEY1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM88Q6PEY1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM88Q6PEY1 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM88Q6PEY1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM88Q6PEY1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM88Q6PEY1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM88Q6PEY1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM88Q6PEY1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM88Q6PEY1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM88Q6PEY1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM88Q6PEY1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM88Q6PEY1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TMEM88Q6PEY1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM88Q6PEY1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMEM88Q6PEY1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM88Q6PEY1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms