Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCE3

PGM2L1, Glucose 1,6-bisphosphate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGM2L1Q6PCE3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PGM2L1Q6PCE3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PGM2L1Q6PCE3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PGM2L1Q6PCE3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PGM2L1Q6PCE3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PGM2L1Q6PCE3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PGM2L1Q6PCE3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PGM2L1Q6PCE3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PGM2L1Q6PCE3 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PGM2L1Q6PCE3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PGM2L1Q6PCE3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PGM2L1Q6PCE3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PGM2L1Q6PCE3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PGM2L1Q6PCE3 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PGM2L1Q6PCE3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PGM2L1Q6PCE3 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PGM2L1Q6PCE3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PGM2L1Q6PCE3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PGM2L1Q6PCE3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PGM2L1Q6PCE3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PGM2L1Q6PCE3 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PGM2L1Q6PCE3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PGM2L1Q6PCE3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PGM2L1Q6PCE3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PGM2L1Q6PCE3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PGM2L1Q6PCE3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PGM2L1Q6PCE3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PGM2L1Q6PCE3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PGM2L1Q6PCE3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PGM2L1Q6PCE3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PGM2L1Q6PCE3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PGM2L1Q6PCE3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PGM2L1Q6PCE3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PGM2L1Q6PCE3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PGM2L1Q6PCE3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PGM2L1Q6PCE3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PGM2L1Q6PCE3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PGM2L1Q6PCE3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PGM2L1Q6PCE3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PGM2L1Q6PCE3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PGM2L1Q6PCE3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PGM2L1Q6PCE3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PGM2L1Q6PCE3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PGM2L1Q6PCE3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PGM2L1Q6PCE3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PGM2L1Q6PCE3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PGM2L1Q6PCE3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PGM2L1Q6PCE3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PGM2L1Q6PCE3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PGM2L1Q6PCE3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PGM2L1Q6PCE3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PGM2L1Q6PCE3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PGM2L1Q6PCE3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PGM2L1Q6PCE3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PGM2L1Q6PCE3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PGM2L1Q6PCE3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PGM2L1Q6PCE3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PGM2L1Q6PCE3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PGM2L1Q6PCE3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PGM2L1Q6PCE3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PGM2L1Q6PCE3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PGM2L1Q6PCE3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PGM2L1Q6PCE3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PGM2L1Q6PCE3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PGM2L1Q6PCE3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PGM2L1Q6PCE3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PGM2L1Q6PCE3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PGM2L1Q6PCE3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PGM2L1Q6PCE3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PGM2L1Q6PCE3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PGM2L1Q6PCE3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PGM2L1Q6PCE3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PGM2L1Q6PCE3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PGM2L1Q6PCE3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PGM2L1Q6PCE3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PGM2L1Q6PCE3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PGM2L1Q6PCE3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PGM2L1Q6PCE3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PGM2L1Q6PCE3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PGM2L1Q6PCE3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PGM2L1Q6PCE3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PGM2L1Q6PCE3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PGM2L1Q6PCE3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PGM2L1Q6PCE3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PGM2L1Q6PCE3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PGM2L1Q6PCE3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PGM2L1Q6PCE3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PGM2L1Q6PCE3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PGM2L1Q6PCE3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PGM2L1Q6PCE3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PGM2L1Q6PCE3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PGM2L1Q6PCE3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PGM2L1Q6PCE3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PGM2L1Q6PCE3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PGM2L1Q6PCE3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PGM2L1Q6PCE3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PGM2L1Q6PCE3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PGM2L1Q6PCE3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PGM2L1Q6PCE3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PGM2L1Q6PCE3 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms