Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.176e-24■■■■■ 88.5
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PRPF8Q6P2Q9 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.366e-22■■■■■ 82.4
PRPF8Q6P2Q9 CTPS2-203ENST00000443824 4319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.696e-22■■■■■ 82.4
PRPF8Q6P2Q9 CTPS2-202ENST00000380241 3526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.366e-22■■■■■ 82.4
PRPF8Q6P2Q9 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.622e-7■■■■■ 82.4
PRPF8Q6P2Q9 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.822e-7■■■■■ 82.4
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PRPF8Q6P2Q9 CCNT2-210ENST00000475094 606 ntTSL 213.09□□□□□ -0.315e-9■■■■■ 82.2
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PRPF8Q6P2Q9 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.823e-19■■■■■ 82.1
PRPF8Q6P2Q9 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.962e-13■■■■■ 82
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PRPF8Q6P2Q9 SMC4-219ENST00000487747 637 ntTSL 5-0.1□□□□□ -2.437e-9■■■■■ 81.8
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