RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460704.1

SETD4-213, Transcript of SET domain containing 4, humanhuman

TSL 3

Gene SETD4, Length 795 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD4-213ENST00000460704 NISCHQ9Y2I1 1504 aa34.57■■■■□ 3.12
SETD4-213ENST00000460704 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa30.91■■■□□ 2.54
SETD4-213ENST00000460704 ABCC9O60706 1549 aa30.26■■■□□ 2.43
SETD4-213ENST00000460704 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.11■■■□□ 2.25
SETD4-213ENST00000460704 NACADO15069 1562 aa29.03■■■□□ 2.24
SETD4-213ENST00000460704 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.82■■■□□ 2.2
SETD4-213ENST00000460704 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.8■■■□□ 2.2
SETD4-213ENST00000460704 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
SETD4-213ENST00000460704 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.64■■■□□ 2.17
SETD4-213ENST00000460704 UNC13AQ9UPW8 1703 aa28.51■■■□□ 2.15
SETD4-213ENST00000460704 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.22■■■□□ 2.11
SETD4-213ENST00000460704 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP28.17■■■□□ 2.1
SETD4-213ENST00000460704 SCRIBQ14160 1630 aa28.12■■■□□ 2.09
SETD4-213ENST00000460704 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.95■■■□□ 2.07
SETD4-213ENST00000460704 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.83■■■□□ 2.05
SETD4-213ENST00000460704 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP27.48■■□□□ 1.99
SETD4-213ENST00000460704 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.41■■□□□ 1.98
SETD4-213ENST00000460704 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.21■■□□□ 1.95
SETD4-213ENST00000460704 SMARCA4P51532 1647 aa26.9■■□□□ 1.9
SETD4-213ENST00000460704 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
SETD4-213ENST00000460704 SMARCA2P51531 1590 aa26.75■■□□□ 1.87
SETD4-213ENST00000460704 NCAPD3P42695 1498 aa26.74■■□□□ 1.87
SETD4-213ENST00000460704 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.74■■□□□ 1.87
SETD4-213ENST00000460704 HMGXB3Q12766 1538 aa26.66■■□□□ 1.86
SETD4-213ENST00000460704 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.65■■□□□ 1.86
SETD4-213ENST00000460704 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.63■■□□□ 1.85
SETD4-213ENST00000460704 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
SETD4-213ENST00000460704 WIZO95785 1651 aa26.37■■□□□ 1.81
SETD4-213ENST00000460704 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
SETD4-213ENST00000460704 NESP48681 1621 aa26.14■■□□□ 1.78
SETD4-213ENST00000460704 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.12■■□□□ 1.77
SETD4-213ENST00000460704 ERCC6Q03468 1493 aa26.11■■□□□ 1.77
SETD4-213ENST00000460704 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
SETD4-213ENST00000460704 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.94■■□□□ 1.74
SETD4-213ENST00000460704 CUX2O14529 1486 aa25.92■■□□□ 1.74
SETD4-213ENST00000460704 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.91■■□□□ 1.74
SETD4-213ENST00000460704 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.89■■□□□ 1.74
SETD4-213ENST00000460704 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
SETD4-213ENST00000460704 CFTRP13569 1480 aa25.79■■□□□ 1.72
SETD4-213ENST00000460704 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.72■■□□□ 1.71
SETD4-213ENST00000460704 PRDM2Q13029 1718 aa25.71■■□□□ 1.71
SETD4-213ENST00000460704 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.67■■□□□ 1.7
SETD4-213ENST00000460704 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.66■■□□□ 1.7
SETD4-213ENST00000460704 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.66■■□□□ 1.7
SETD4-213ENST00000460704 WDR62O43379 1518 aa25.61■■□□□ 1.69
SETD4-213ENST00000460704 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
SETD4-213ENST00000460704 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
SETD4-213ENST00000460704 TOPBP1Q92547 1522 aa25.26■■□□□ 1.63
SETD4-213ENST00000460704 ABCC8Q09428 1581 aa25.25■■□□□ 1.63
SETD4-213ENST00000460704 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.24■■□□□ 1.63
SETD4-213ENST00000460704 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.21■■□□□ 1.63
SETD4-213ENST00000460704 IFT140Q96RY7 1462 aa25.13■■□□□ 1.61
SETD4-213ENST00000460704 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
SETD4-213ENST00000460704 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
SETD4-213ENST00000460704 CUX1P39880 1505 aa25.01■■□□□ 1.59
SETD4-213ENST00000460704 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
SETD4-213ENST00000460704 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
SETD4-213ENST00000460704 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.94■■□□□ 1.58
SETD4-213ENST00000460704 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.88■■□□□ 1.57
SETD4-213ENST00000460704 SOGA1O94964 1423 aa24.87■■□□□ 1.57
SETD4-213ENST00000460704 WDR97A6NE52 1622 aa24.86■■□□□ 1.57
SETD4-213ENST00000460704 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.82■■□□□ 1.564e-7■■■■□ 21.4
SETD4-213ENST00000460704 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.81■■□□□ 1.56
SETD4-213ENST00000460704 TOP2BQ02880 1626 aa24.78■■□□□ 1.56
SETD4-213ENST00000460704 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.77■■□□□ 1.56
SETD4-213ENST00000460704 SYNJ1O43426 1573 aa24.76■■□□□ 1.55
SETD4-213ENST00000460704 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
SETD4-213ENST00000460704 OSCARQ8IYS5 282 aa24.73■■□□□ 1.55
SETD4-213ENST00000460704 CHD1O14646 1710 aa24.71■■□□□ 1.55
SETD4-213ENST00000460704 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.71■■□□□ 1.55
SETD4-213ENST00000460704 PBRM1Q86U86 1689 aa24.67■■□□□ 1.54
SETD4-213ENST00000460704 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.66■■□□□ 1.54
SETD4-213ENST00000460704 GRIN2BQ13224 1484 aa24.64■■□□□ 1.54
SETD4-213ENST00000460704 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.64■■□□□ 1.53
SETD4-213ENST00000460704 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.62■■□□□ 1.53
SETD4-213ENST00000460704 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
SETD4-213ENST00000460704 SYNJ2O15056 1496 aa24.51■■□□□ 1.51
SETD4-213ENST00000460704 FBLN2P98095 1184 aa24.5■■□□□ 1.51
SETD4-213ENST00000460704 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.45■■□□□ 1.5
SETD4-213ENST00000460704 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.45■■□□□ 1.5
SETD4-213ENST00000460704 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.45■■□□□ 1.5
SETD4-213ENST00000460704 ADAMTS12P58397 1594 aa24.43■■□□□ 1.5
SETD4-213ENST00000460704 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
SETD4-213ENST00000460704 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.42■■□□□ 1.5
SETD4-213ENST00000460704 ARHGEF11O15085 1522 aa24.4■■□□□ 1.5
SETD4-213ENST00000460704 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.4■■□□□ 1.5
SETD4-213ENST00000460704 GRIN2AQ12879 1464 aa24.33■■□□□ 1.49
SETD4-213ENST00000460704 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.33■■□□□ 1.49
SETD4-213ENST00000460704 TRIM41Q8WV44 630 aa24.29■■□□□ 1.48
SETD4-213ENST00000460704 KIF27Q86VH2 1401 aa24.26■■□□□ 1.47
SETD4-213ENST00000460704 CEP170Q5SW79 1584 aa24.24■■□□□ 1.47
SETD4-213ENST00000460704 NUP160Q12769 1436 aa24.23■■□□□ 1.47
SETD4-213ENST00000460704 CUL7Q14999 1698 aa24.21■■□□□ 1.47
SETD4-213ENST00000460704 ARAP1Q96P48 1450 aa24.19■■□□□ 1.46
SETD4-213ENST00000460704 IGF1RP08069 1367 aa24.14■■□□□ 1.45
SETD4-213ENST00000460704 SHROOM2Q13796 1616 aa24.12■■□□□ 1.45
SETD4-213ENST00000460704 CYB5RLQ6IPT4 315 aa24.09■■□□□ 1.45
SETD4-213ENST00000460704 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.08■■□□□ 1.45
SETD4-213ENST00000460704 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.02■■□□□ 1.44
SETD4-213ENST00000460704 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 89.8 ms