Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 SLC17A9-206ENST00000487303 507 ntTSL 214.25□□□□□ -0.131e-323■□□□□ 8.8
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PRPF8Q6P2Q9 MALAT1-202ENST00000534336 8708 ntBASIC8.48□□□□□ -1.051e-323■■■■□ 20.1
PRPF8Q6P2Q9 TF-205ENST00000462495 582 ntTSL 26.82□□□□□ -1.321e-323■□□□□ 8.1
PRPF8Q6P2Q9 MALAT1-208ENST00000616527 572 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.431e-323■■■□□ 17.4
PRPF8Q6P2Q9 A2M-210ENST00000542567 563 ntTSL 45.8□□□□□ -1.481e-323■■□□□ 14.4
PRPF8Q6P2Q9 MALAT1-212ENST00000618132 725 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.611e-323■■■□□ 17.4
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PRPF8Q6P2Q9 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.763e-58■■■■■ 199
PRPF8Q6P2Q9 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.83e-58■■■■■ 199
PRPF8Q6P2Q9 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC-3.98□□□□□ -3.053e-58■■■■■ 199
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PRPF8Q6P2Q9 CCDC102B-211ENST00000584775 1179 ntTSL 1 (best)8.83□□□□□ -13e-57■■■■■ 58.3
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PRPF8Q6P2Q9 CCDC102B-210ENST00000584156 1554 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.53e-57■■■■■ 58.3
PRPF8Q6P2Q9 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.853e-57■■■■■ 58.3
PRPF8Q6P2Q9 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.333e-57■■■■■ 58.3
PRPF8Q6P2Q9 CCDC102B-203ENST00000577800 589 ntTSL 3-0.05□□□□□ -2.423e-57■■■■■ 58.3
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PRPF8Q6P2Q9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.564e-54■□□□□ 10.8
PRPF8Q6P2Q9 METTL2A-203ENST00000582027 572 ntTSL 24.98□□□□□ -1.616e-54■■■■■ 101.2
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