RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556400.5

PSMA3-AS1-212, PSMA3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene PSMA3-AS1, Length 604 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.49■■■■□ 3.27
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 ABCC9O60706 1549 aa31.9■■■□□ 2.7
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa31.79■■■□□ 2.68
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.29■■■□□ 2.44
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 NACADO15069 1562 aa30.08■■■□□ 2.41
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30■■■□□ 2.39
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.97■■■□□ 2.39
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.73■■■□□ 2.35
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.66■■■□□ 2.34
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.6■■■□□ 2.33
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.46■■■□□ 2.31
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.28■■■□□ 2.28
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 SCRIBQ14160 1630 aa29.05■■■□□ 2.24
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29■■■□□ 2.23
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.79■■■□□ 2.2
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.72■■■□□ 2.19
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 NCAPD3P42695 1498 aa27.8■■■□□ 2.04
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.74■■■□□ 2.03
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 SMARCA4P51532 1647 aa27.68■■■□□ 2.02
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 SMARCA2P51531 1590 aa27.62■■■□□ 2.01
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 HMGXB3Q12766 1538 aa27.58■■■□□ 2.01
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 ERCC6Q03468 1493 aa27.53■■■□□ 2
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27.47■■□□□ 1.99
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.46■■□□□ 1.99
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 CUX2O14529 1486 aa27.44■■□□□ 1.98
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 NESP48681 1621 aa27.41■■□□□ 1.98
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.4■■□□□ 1.98
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.38■■□□□ 1.97
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.14■■□□□ 1.94
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 WIZO95785 1651 aa27.02■■□□□ 1.92
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.01■■□□□ 1.91
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.01■■□□□ 1.91
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.97■■□□□ 1.91
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.8■■□□□ 1.88
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 WDR62O43379 1518 aa26.74■■□□□ 1.87
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.68■■□□□ 1.86
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.67■■□□□ 1.86
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 CFTRP13569 1480 aa26.66■■□□□ 1.86
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.4■■□□□ 1.82
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 PRDM2Q13029 1718 aa26.31■■□□□ 1.8
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 TRIM41Q8WV44 630 aa26.3■■□□□ 1.8
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 OSCARQ8IYS5 282 aa26.21■■□□□ 1.79
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 TOPBP1Q92547 1522 aa26.16■■□□□ 1.78
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 IFT140Q96RY7 1462 aa26.15■■□□□ 1.78
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 ABCC8Q09428 1581 aa26.04■■□□□ 1.76
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.04■■□□□ 1.76
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.91■■□□□ 1.741e-8■■■□□ 16.1
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.87■■□□□ 1.73
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.87■■□□□ 1.73
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.87■■□□□ 1.73
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.83■■□□□ 1.73
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 ARHGEF11O15085 1522 aa25.81■■□□□ 1.72
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 SOGA1O94964 1423 aa25.77■■□□□ 1.72
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 CHD1O14646 1710 aa25.76■■□□□ 1.71
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.74■■□□□ 1.71
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 FBLN2P98095 1184 aa25.74■■□□□ 1.71
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 CUX1P39880 1505 aa25.72■■□□□ 1.71
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.7
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.64■■□□□ 1.69
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.63■■□□□ 1.69
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 WDR97A6NE52 1622 aa25.59■■□□□ 1.69
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 ARAP1Q96P48 1450 aa25.57■■□□□ 1.68
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 GRIN2BQ13224 1484 aa25.54■■□□□ 1.68
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.48■■□□□ 1.67
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 SYNJ2O15056 1496 aa25.47■■□□□ 1.67
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.46■■□□□ 1.67
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 SYNJ1O43426 1573 aa25.44■■□□□ 1.66
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.43■■□□□ 1.66
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 PBRM1Q86U86 1689 aa25.41■■□□□ 1.66
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.39■■□□□ 1.66
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 TRHP20396 242 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.33■■□□□ 1.65
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 TOP2BQ02880 1626 aa25.27■■□□□ 1.64
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.25■■□□□ 1.63
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 GRIN2AQ12879 1464 aa25.22■■□□□ 1.63
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 ADAMTS12P58397 1594 aa25.21■■□□□ 1.63
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 CEP170Q5SW79 1584 aa25.14■■□□□ 1.62
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 NUP160Q12769 1436 aa25.14■■□□□ 1.62
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.13■■□□□ 1.61
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.12■■□□□ 1.61
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.09■■□□□ 1.61
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 SHROOM2Q13796 1616 aa25.01■■□□□ 1.59
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 JPH4Q96JJ6 628 aa24.88■■□□□ 1.57
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.86■■□□□ 1.57
PSMA3-AS1-212ENST00000556400 IGF1RP08069 1367 aa24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.2 ms