RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555275.5

PSMA3-AS1-208, PSMA3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PSMA3-AS1, Length 903 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 NISCHQ9Y2I1 1504 aa28.61■■■□□ 2.17
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.6■■■□□ 2.01
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa25.18■■□□□ 1.62
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 ABCC9O60706 1549 aa24.51■■□□□ 1.51
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 DCAF8L2P0C7V8 631 aa23.87■■□□□ 1.41
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 NACADO15069 1562 aa23.69■■□□□ 1.38
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 MYO15BQ96JP2 1530 aa23.67■■□□□ 1.38
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa23.67■■□□□ 1.38
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa23.63■■□□□ 1.37
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 SCRIBQ14160 1630 aa23.04■■□□□ 1.28
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.03■■□□□ 1.28
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 UNC13AQ9UPW8 1703 aa22.98■■□□□ 1.27
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 BICRAQ9NZM4 1560 aa22.94■■□□□ 1.26
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa22.8■■□□□ 1.24
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.55■■□□□ 1.2
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 DNAJC5BQ9UF47 199 aa22.37■■□□□ 1.17
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.3■■□□□ 1.16
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.13■■□□□ 1.13
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 SMARCA4P51532 1647 aa22.08■■□□□ 1.13
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 FOXD1Q16676 465 aa22.06■■□□□ 1.12
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.06■■□□□ 1.12
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa21.97■■□□□ 1.11
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 NCAPD3P42695 1498 aa21.94■■□□□ 1.1
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 SMARCA2P51531 1590 aa21.89■■□□□ 1.09
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 PEG3Q9GZU2 1588 aa21.88■■□□□ 1.09
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 WIZO95785 1651 aa21.77■■□□□ 1.08
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.07
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 HMGXB3Q12766 1538 aa21.76■■□□□ 1.07
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 CCDC88BA6NC98 1476 aa21.39■■□□□ 1.02
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.33■■□□□ 1
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 ADRA2BP18089 450 aa21.3■■□□□ 1
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 NESP48681 1621 aa21.29■■□□□ 1
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 PPP6R1Q9UPN7 881 aa21.29■■□□□ 1
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 CFTRP13569 1480 aa21.23■□□□□ 0.99
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa21.22■□□□□ 0.99
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.13■□□□□ 0.97
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 ERCC6Q03468 1493 aa21.07■□□□□ 0.96
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.03■□□□□ 0.96
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 CEP164Q9UPV0 1460 aa20.95■□□□□ 0.94
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa20.92■□□□□ 0.94
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 MRC2Q9UBG0 1479 aa20.88■□□□□ 0.93
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 PRDM2Q13029 1718 aa20.85■□□□□ 0.93
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.92
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 WDR62O43379 1518 aa20.78■□□□□ 0.92
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 CUX2O14529 1486 aa20.75■□□□□ 0.91
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 ABCC8Q09428 1581 aa20.72■□□□□ 0.91
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 TOPBP1Q92547 1522 aa20.72■□□□□ 0.91
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 DNMBPQ6XZF7 1577 aa20.68■□□□□ 0.9
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 CUX1P39880 1505 aa20.67■□□□□ 0.9
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP20.65■□□□□ 0.9
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 FGD5Q6ZNL6 1462 aa20.56■□□□□ 0.88
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 SYNJ1O43426 1573 aa20.54■□□□□ 0.88
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 SOGA1O94964 1423 aa20.53■□□□□ 0.88
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 IFT140Q96RY7 1462 aa20.52■□□□□ 0.88
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 TOP2BQ02880 1626 aa20.52■□□□□ 0.88
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa20.5■□□□□ 0.87
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa20.48■□□□□ 0.87
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 MSH5O43196 834 aa20.44■□□□□ 0.86
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa20.43■□□□□ 0.86
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 TRIM41Q8WV44 630 aa20.41■□□□□ 0.86
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP20.37■□□□□ 0.851e-8■■■□□ 16.1
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa20.37■□□□□ 0.85
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.26■□□□□ 0.83
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 WDR97A6NE52 1622 aa20.26■□□□□ 0.83
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 GRIN2BQ13224 1484 aa20.22■□□□□ 0.83
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa20.2■□□□□ 0.82
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 KIF27Q86VH2 1401 aa20.2■□□□□ 0.82
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 IGF1RP08069 1367 aa20.15■□□□□ 0.82
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa20.14■□□□□ 0.81
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa20.14■□□□□ 0.81
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 ERICH3Q5RHP9 1530 aa20.11■□□□□ 0.81
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 FBLN2P98095 1184 aa20.08■□□□□ 0.81
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.05■□□□□ 0.8
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 PBRM1Q86U86 1689 aa20.05■□□□□ 0.8
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 SYNJ2O15056 1496 aa20.05■□□□□ 0.8
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 OSCARQ8IYS5 282 aa20.04■□□□□ 0.8
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa20.01■□□□□ 0.79
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 CSRNP3Q8WYN3 585 aa20■□□□□ 0.79
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 EEA1Q15075 1411 aa19.99■□□□□ 0.79
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 ADAMTS12P58397 1594 aa19.99■□□□□ 0.79
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
PSMA3-AS1-208ENST00000555275 GRIN2AQ12879 1464 aa19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.4 ms