Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUJ2

C11orf87, Uncharacterized protein C11orf87, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf87Q6NUJ2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C11orf87Q6NUJ2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C11orf87Q6NUJ2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C11orf87Q6NUJ2 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C11orf87Q6NUJ2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
C11orf87Q6NUJ2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C11orf87Q6NUJ2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C11orf87Q6NUJ2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C11orf87Q6NUJ2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C11orf87Q6NUJ2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C11orf87Q6NUJ2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C11orf87Q6NUJ2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C11orf87Q6NUJ2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C11orf87Q6NUJ2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C11orf87Q6NUJ2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C11orf87Q6NUJ2 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C11orf87Q6NUJ2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C11orf87Q6NUJ2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C11orf87Q6NUJ2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C11orf87Q6NUJ2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C11orf87Q6NUJ2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C11orf87Q6NUJ2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C11orf87Q6NUJ2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C11orf87Q6NUJ2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C11orf87Q6NUJ2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C11orf87Q6NUJ2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C11orf87Q6NUJ2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C11orf87Q6NUJ2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C11orf87Q6NUJ2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
C11orf87Q6NUJ2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C11orf87Q6NUJ2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C11orf87Q6NUJ2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C11orf87Q6NUJ2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C11orf87Q6NUJ2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C11orf87Q6NUJ2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C11orf87Q6NUJ2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C11orf87Q6NUJ2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C11orf87Q6NUJ2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C11orf87Q6NUJ2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C11orf87Q6NUJ2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C11orf87Q6NUJ2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C11orf87Q6NUJ2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C11orf87Q6NUJ2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C11orf87Q6NUJ2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C11orf87Q6NUJ2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C11orf87Q6NUJ2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C11orf87Q6NUJ2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C11orf87Q6NUJ2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C11orf87Q6NUJ2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C11orf87Q6NUJ2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C11orf87Q6NUJ2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C11orf87Q6NUJ2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C11orf87Q6NUJ2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C11orf87Q6NUJ2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C11orf87Q6NUJ2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C11orf87Q6NUJ2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C11orf87Q6NUJ2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C11orf87Q6NUJ2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C11orf87Q6NUJ2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C11orf87Q6NUJ2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C11orf87Q6NUJ2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C11orf87Q6NUJ2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C11orf87Q6NUJ2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C11orf87Q6NUJ2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C11orf87Q6NUJ2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C11orf87Q6NUJ2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C11orf87Q6NUJ2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C11orf87Q6NUJ2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C11orf87Q6NUJ2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C11orf87Q6NUJ2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C11orf87Q6NUJ2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C11orf87Q6NUJ2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C11orf87Q6NUJ2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C11orf87Q6NUJ2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C11orf87Q6NUJ2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C11orf87Q6NUJ2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C11orf87Q6NUJ2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C11orf87Q6NUJ2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C11orf87Q6NUJ2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C11orf87Q6NUJ2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C11orf87Q6NUJ2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C11orf87Q6NUJ2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C11orf87Q6NUJ2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C11orf87Q6NUJ2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C11orf87Q6NUJ2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C11orf87Q6NUJ2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C11orf87Q6NUJ2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C11orf87Q6NUJ2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C11orf87Q6NUJ2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
C11orf87Q6NUJ2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C11orf87Q6NUJ2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C11orf87Q6NUJ2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C11orf87Q6NUJ2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C11orf87Q6NUJ2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C11orf87Q6NUJ2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C11orf87Q6NUJ2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
C11orf87Q6NUJ2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C11orf87Q6NUJ2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C11orf87Q6NUJ2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C11orf87Q6NUJ2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms