Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC44.42■■■■■ 4.7
CARMIL2Q6F5E8 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
CARMIL2Q6F5E8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
CARMIL2Q6F5E8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC44.4■■■■■ 4.7
CARMIL2Q6F5E8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
CARMIL2Q6F5E8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.37■■■■■ 4.69
CARMIL2Q6F5E8 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.37■■■■■ 4.69
CARMIL2Q6F5E8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
CARMIL2Q6F5E8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.36■■■■■ 4.69
CARMIL2Q6F5E8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC44.34■■■■■ 4.69
CARMIL2Q6F5E8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
CARMIL2Q6F5E8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC44.33■■■■■ 4.69
CARMIL2Q6F5E8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
CARMIL2Q6F5E8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC44.33■■■■■ 4.69
CARMIL2Q6F5E8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
CARMIL2Q6F5E8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.68
CARMIL2Q6F5E8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC44.32■■■■■ 4.68
CARMIL2Q6F5E8 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.29■■■■■ 4.68
CARMIL2Q6F5E8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC44.28■■■■■ 4.68
CARMIL2Q6F5E8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
CARMIL2Q6F5E8 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
CARMIL2Q6F5E8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC44.26■■■■■ 4.68
CARMIL2Q6F5E8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC44.23■■■■■ 4.67
CARMIL2Q6F5E8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC44.23■■■■■ 4.67
CARMIL2Q6F5E8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC44.22■■■■■ 4.67
CARMIL2Q6F5E8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
CARMIL2Q6F5E8 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
CARMIL2Q6F5E8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
CARMIL2Q6F5E8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.17■■■■■ 4.66
CARMIL2Q6F5E8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC44.16■■■■■ 4.66
CARMIL2Q6F5E8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.16■■■■■ 4.66
CARMIL2Q6F5E8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
CARMIL2Q6F5E8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
CARMIL2Q6F5E8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC44.13■■■■■ 4.65
CARMIL2Q6F5E8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC44.13■■■■■ 4.65
CARMIL2Q6F5E8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
CARMIL2Q6F5E8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
CARMIL2Q6F5E8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
CARMIL2Q6F5E8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC44.09■■■■■ 4.65
CARMIL2Q6F5E8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
CARMIL2Q6F5E8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC44.07■■■■■ 4.64
CARMIL2Q6F5E8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC44.07■■■■■ 4.64
CARMIL2Q6F5E8 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
CARMIL2Q6F5E8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
CARMIL2Q6F5E8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC44.01■■■■■ 4.64
CARMIL2Q6F5E8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC43.99■■■■■ 4.63
CARMIL2Q6F5E8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC43.99■■■■■ 4.63
CARMIL2Q6F5E8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
CARMIL2Q6F5E8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.63
CARMIL2Q6F5E8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
CARMIL2Q6F5E8 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.93■■■■■ 4.62
CARMIL2Q6F5E8 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC43.93■■■■■ 4.62
CARMIL2Q6F5E8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC43.92■■■■■ 4.62
CARMIL2Q6F5E8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
CARMIL2Q6F5E8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.91■■■■■ 4.62
CARMIL2Q6F5E8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC43.9■■■■■ 4.62
CARMIL2Q6F5E8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
CARMIL2Q6F5E8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.61
CARMIL2Q6F5E8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
CARMIL2Q6F5E8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.86■■■■■ 4.61
CARMIL2Q6F5E8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
CARMIL2Q6F5E8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC43.83■■■■■ 4.61
CARMIL2Q6F5E8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC43.83■■■■■ 4.61
CARMIL2Q6F5E8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
CARMIL2Q6F5E8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
CARMIL2Q6F5E8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.6
CARMIL2Q6F5E8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC43.82■■■■■ 4.6
CARMIL2Q6F5E8 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC43.8■■■■■ 4.6
CARMIL2Q6F5E8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC43.79■■■■■ 4.6
CARMIL2Q6F5E8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC43.79■■■■■ 4.6
CARMIL2Q6F5E8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC43.78■■■■■ 4.6
CARMIL2Q6F5E8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC43.77■■■■■ 4.6
CARMIL2Q6F5E8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC43.76■■■■■ 4.6
CARMIL2Q6F5E8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC43.76■■■■■ 4.6
CARMIL2Q6F5E8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC43.75■■■■■ 4.59
CARMIL2Q6F5E8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
CARMIL2Q6F5E8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC43.69■■■■■ 4.58
CARMIL2Q6F5E8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
CARMIL2Q6F5E8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
CARMIL2Q6F5E8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC43.67■■■■■ 4.58
CARMIL2Q6F5E8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
CARMIL2Q6F5E8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC43.66■■■■■ 4.58
CARMIL2Q6F5E8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC43.66■■■■■ 4.58
CARMIL2Q6F5E8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.66■■■■■ 4.58
CARMIL2Q6F5E8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC43.65■■■■■ 4.58
CARMIL2Q6F5E8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.65■■■■■ 4.58
CARMIL2Q6F5E8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.65■■■■■ 4.58
CARMIL2Q6F5E8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC43.64■■■■■ 4.58
CARMIL2Q6F5E8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.58
CARMIL2Q6F5E8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.58
CARMIL2Q6F5E8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC43.63■■■■■ 4.57
CARMIL2Q6F5E8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC43.62■■■■■ 4.57
CARMIL2Q6F5E8 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
CARMIL2Q6F5E8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC43.61■■■■■ 4.57
CARMIL2Q6F5E8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC43.61■■■■■ 4.57
CARMIL2Q6F5E8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.6■■■■■ 4.57
CARMIL2Q6F5E8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC43.6■■■■■ 4.57
CARMIL2Q6F5E8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC43.59■■■■■ 4.57
CARMIL2Q6F5E8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
CARMIL2Q6F5E8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC43.58■■■■■ 4.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms