Protein–RNA interactions for Protein: Q68G74

LHX8, LIM/homeobox protein Lhx8, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX8Q68G74 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
LHX8Q68G74 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
LHX8Q68G74 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
LHX8Q68G74 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
LHX8Q68G74 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
LHX8Q68G74 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
LHX8Q68G74 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
LHX8Q68G74 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
LHX8Q68G74 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
LHX8Q68G74 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
LHX8Q68G74 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
LHX8Q68G74 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
LHX8Q68G74 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
LHX8Q68G74 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC30.98■■■□□ 2.55
LHX8Q68G74 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
LHX8Q68G74 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
LHX8Q68G74 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
LHX8Q68G74 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.96■■■□□ 2.55
LHX8Q68G74 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
LHX8Q68G74 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
LHX8Q68G74 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
LHX8Q68G74 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
LHX8Q68G74 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
LHX8Q68G74 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
LHX8Q68G74 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
LHX8Q68G74 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
LHX8Q68G74 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
LHX8Q68G74 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
LHX8Q68G74 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
LHX8Q68G74 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
LHX8Q68G74 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
LHX8Q68G74 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
LHX8Q68G74 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
LHX8Q68G74 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
LHX8Q68G74 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
LHX8Q68G74 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
LHX8Q68G74 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
LHX8Q68G74 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
LHX8Q68G74 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
LHX8Q68G74 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
LHX8Q68G74 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52
LHX8Q68G74 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
LHX8Q68G74 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
LHX8Q68G74 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
LHX8Q68G74 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
LHX8Q68G74 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
LHX8Q68G74 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
LHX8Q68G74 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
LHX8Q68G74 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
LHX8Q68G74 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
LHX8Q68G74 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
LHX8Q68G74 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
LHX8Q68G74 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
LHX8Q68G74 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
LHX8Q68G74 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
LHX8Q68G74 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
LHX8Q68G74 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.68■■■□□ 2.5
LHX8Q68G74 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
LHX8Q68G74 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
LHX8Q68G74 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
LHX8Q68G74 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
LHX8Q68G74 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
LHX8Q68G74 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
LHX8Q68G74 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
LHX8Q68G74 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
LHX8Q68G74 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
LHX8Q68G74 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
LHX8Q68G74 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
LHX8Q68G74 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
LHX8Q68G74 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
LHX8Q68G74 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
LHX8Q68G74 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC30.6■■■□□ 2.49
LHX8Q68G74 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
LHX8Q68G74 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
LHX8Q68G74 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
LHX8Q68G74 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC30.58■■■□□ 2.49
LHX8Q68G74 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
LHX8Q68G74 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
LHX8Q68G74 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
LHX8Q68G74 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
LHX8Q68G74 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
LHX8Q68G74 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
LHX8Q68G74 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
LHX8Q68G74 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
LHX8Q68G74 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.47
LHX8Q68G74 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
LHX8Q68G74 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
LHX8Q68G74 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
LHX8Q68G74 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
LHX8Q68G74 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
LHX8Q68G74 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
LHX8Q68G74 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
LHX8Q68G74 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
LHX8Q68G74 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
LHX8Q68G74 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
LHX8Q68G74 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
LHX8Q68G74 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
LHX8Q68G74 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
LHX8Q68G74 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
LHX8Q68G74 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms