Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SHEQ5VZ18 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SHEQ5VZ18 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SHEQ5VZ18 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHEQ5VZ18 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SHEQ5VZ18 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SHEQ5VZ18 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SHEQ5VZ18 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SHEQ5VZ18 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SHEQ5VZ18 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SHEQ5VZ18 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SHEQ5VZ18 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SHEQ5VZ18 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SHEQ5VZ18 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SHEQ5VZ18 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SHEQ5VZ18 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHEQ5VZ18 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SHEQ5VZ18 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHEQ5VZ18 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SHEQ5VZ18 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SHEQ5VZ18 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SHEQ5VZ18 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SHEQ5VZ18 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SHEQ5VZ18 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHEQ5VZ18 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHEQ5VZ18 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SHEQ5VZ18 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHEQ5VZ18 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHEQ5VZ18 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SHEQ5VZ18 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SHEQ5VZ18 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SHEQ5VZ18 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SHEQ5VZ18 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SHEQ5VZ18 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHEQ5VZ18 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHEQ5VZ18 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SHEQ5VZ18 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SHEQ5VZ18 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SHEQ5VZ18 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SHEQ5VZ18 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHEQ5VZ18 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHEQ5VZ18 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SHEQ5VZ18 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHEQ5VZ18 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHEQ5VZ18 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SHEQ5VZ18 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SHEQ5VZ18 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHEQ5VZ18 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SHEQ5VZ18 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHEQ5VZ18 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHEQ5VZ18 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHEQ5VZ18 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SHEQ5VZ18 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHEQ5VZ18 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHEQ5VZ18 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHEQ5VZ18 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHEQ5VZ18 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHEQ5VZ18 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHEQ5VZ18 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHEQ5VZ18 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SHEQ5VZ18 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SHEQ5VZ18 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHEQ5VZ18 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHEQ5VZ18 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHEQ5VZ18 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHEQ5VZ18 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHEQ5VZ18 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHEQ5VZ18 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHEQ5VZ18 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHEQ5VZ18 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHEQ5VZ18 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHEQ5VZ18 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SHEQ5VZ18 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHEQ5VZ18 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHEQ5VZ18 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHEQ5VZ18 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHEQ5VZ18 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SHEQ5VZ18 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SHEQ5VZ18 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHEQ5VZ18 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SHEQ5VZ18 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHEQ5VZ18 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHEQ5VZ18 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SHEQ5VZ18 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHEQ5VZ18 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHEQ5VZ18 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SHEQ5VZ18 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SHEQ5VZ18 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SHEQ5VZ18 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHEQ5VZ18 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SHEQ5VZ18 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHEQ5VZ18 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SHEQ5VZ18 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHEQ5VZ18 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHEQ5VZ18 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHEQ5VZ18 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SHEQ5VZ18 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SHEQ5VZ18 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SHEQ5VZ18 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SHEQ5VZ18 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms