Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM6

PRAMEF13, Putative PRAME family member 13, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF13Q5VWM6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRAMEF13Q5VWM6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRAMEF13Q5VWM6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRAMEF13Q5VWM6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRAMEF13Q5VWM6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRAMEF13Q5VWM6 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PRAMEF13Q5VWM6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRAMEF13Q5VWM6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRAMEF13Q5VWM6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRAMEF13Q5VWM6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRAMEF13Q5VWM6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRAMEF13Q5VWM6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRAMEF13Q5VWM6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRAMEF13Q5VWM6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRAMEF13Q5VWM6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRAMEF13Q5VWM6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRAMEF13Q5VWM6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PRAMEF13Q5VWM6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PRAMEF13Q5VWM6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRAMEF13Q5VWM6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRAMEF13Q5VWM6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PRAMEF13Q5VWM6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRAMEF13Q5VWM6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRAMEF13Q5VWM6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRAMEF13Q5VWM6 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRAMEF13Q5VWM6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PRAMEF13Q5VWM6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRAMEF13Q5VWM6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRAMEF13Q5VWM6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRAMEF13Q5VWM6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRAMEF13Q5VWM6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRAMEF13Q5VWM6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRAMEF13Q5VWM6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRAMEF13Q5VWM6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRAMEF13Q5VWM6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRAMEF13Q5VWM6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRAMEF13Q5VWM6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PRAMEF13Q5VWM6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRAMEF13Q5VWM6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PRAMEF13Q5VWM6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRAMEF13Q5VWM6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRAMEF13Q5VWM6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRAMEF13Q5VWM6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRAMEF13Q5VWM6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRAMEF13Q5VWM6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PRAMEF13Q5VWM6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRAMEF13Q5VWM6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRAMEF13Q5VWM6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRAMEF13Q5VWM6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRAMEF13Q5VWM6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRAMEF13Q5VWM6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRAMEF13Q5VWM6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRAMEF13Q5VWM6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRAMEF13Q5VWM6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRAMEF13Q5VWM6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRAMEF13Q5VWM6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRAMEF13Q5VWM6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRAMEF13Q5VWM6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRAMEF13Q5VWM6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRAMEF13Q5VWM6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRAMEF13Q5VWM6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRAMEF13Q5VWM6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PRAMEF13Q5VWM6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PRAMEF13Q5VWM6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PRAMEF13Q5VWM6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRAMEF13Q5VWM6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRAMEF13Q5VWM6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRAMEF13Q5VWM6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PRAMEF13Q5VWM6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRAMEF13Q5VWM6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRAMEF13Q5VWM6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRAMEF13Q5VWM6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRAMEF13Q5VWM6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRAMEF13Q5VWM6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRAMEF13Q5VWM6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRAMEF13Q5VWM6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRAMEF13Q5VWM6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRAMEF13Q5VWM6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRAMEF13Q5VWM6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRAMEF13Q5VWM6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRAMEF13Q5VWM6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRAMEF13Q5VWM6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRAMEF13Q5VWM6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRAMEF13Q5VWM6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRAMEF13Q5VWM6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRAMEF13Q5VWM6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRAMEF13Q5VWM6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRAMEF13Q5VWM6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRAMEF13Q5VWM6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PRAMEF13Q5VWM6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRAMEF13Q5VWM6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRAMEF13Q5VWM6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRAMEF13Q5VWM6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRAMEF13Q5VWM6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRAMEF13Q5VWM6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRAMEF13Q5VWM6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRAMEF13Q5VWM6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRAMEF13Q5VWM6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRAMEF13Q5VWM6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRAMEF13Q5VWM6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms