Protein–RNA interactions for Protein: Q5T9A4

ATAD3B, ATPase family AAA domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3BQ5T9A4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATAD3BQ5T9A4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATAD3BQ5T9A4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATAD3BQ5T9A4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATAD3BQ5T9A4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATAD3BQ5T9A4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATAD3BQ5T9A4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATAD3BQ5T9A4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATAD3BQ5T9A4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATAD3BQ5T9A4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATAD3BQ5T9A4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATAD3BQ5T9A4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATAD3BQ5T9A4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATAD3BQ5T9A4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATAD3BQ5T9A4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATAD3BQ5T9A4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATAD3BQ5T9A4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATAD3BQ5T9A4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATAD3BQ5T9A4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATAD3BQ5T9A4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATAD3BQ5T9A4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATAD3BQ5T9A4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATAD3BQ5T9A4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATAD3BQ5T9A4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATAD3BQ5T9A4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATAD3BQ5T9A4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATAD3BQ5T9A4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATAD3BQ5T9A4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATAD3BQ5T9A4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATAD3BQ5T9A4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATAD3BQ5T9A4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATAD3BQ5T9A4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATAD3BQ5T9A4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATAD3BQ5T9A4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATAD3BQ5T9A4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATAD3BQ5T9A4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATAD3BQ5T9A4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ATAD3BQ5T9A4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATAD3BQ5T9A4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATAD3BQ5T9A4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATAD3BQ5T9A4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATAD3BQ5T9A4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATAD3BQ5T9A4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATAD3BQ5T9A4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATAD3BQ5T9A4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATAD3BQ5T9A4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATAD3BQ5T9A4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATAD3BQ5T9A4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATAD3BQ5T9A4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATAD3BQ5T9A4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATAD3BQ5T9A4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATAD3BQ5T9A4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATAD3BQ5T9A4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATAD3BQ5T9A4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATAD3BQ5T9A4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATAD3BQ5T9A4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATAD3BQ5T9A4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATAD3BQ5T9A4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ATAD3BQ5T9A4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATAD3BQ5T9A4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATAD3BQ5T9A4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATAD3BQ5T9A4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATAD3BQ5T9A4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATAD3BQ5T9A4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATAD3BQ5T9A4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATAD3BQ5T9A4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATAD3BQ5T9A4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATAD3BQ5T9A4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATAD3BQ5T9A4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATAD3BQ5T9A4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATAD3BQ5T9A4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATAD3BQ5T9A4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATAD3BQ5T9A4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATAD3BQ5T9A4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATAD3BQ5T9A4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATAD3BQ5T9A4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATAD3BQ5T9A4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATAD3BQ5T9A4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
ATAD3BQ5T9A4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATAD3BQ5T9A4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ATAD3BQ5T9A4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATAD3BQ5T9A4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATAD3BQ5T9A4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATAD3BQ5T9A4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATAD3BQ5T9A4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATAD3BQ5T9A4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATAD3BQ5T9A4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ATAD3BQ5T9A4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ATAD3BQ5T9A4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATAD3BQ5T9A4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATAD3BQ5T9A4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ATAD3BQ5T9A4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ATAD3BQ5T9A4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATAD3BQ5T9A4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATAD3BQ5T9A4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATAD3BQ5T9A4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATAD3BQ5T9A4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATAD3BQ5T9A4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATAD3BQ5T9A4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATAD3BQ5T9A4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.9 ms