Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2R2

PDSS1, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS1Q5T2R2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDSS1Q5T2R2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDSS1Q5T2R2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDSS1Q5T2R2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDSS1Q5T2R2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDSS1Q5T2R2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDSS1Q5T2R2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PDSS1Q5T2R2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDSS1Q5T2R2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDSS1Q5T2R2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDSS1Q5T2R2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDSS1Q5T2R2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PDSS1Q5T2R2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDSS1Q5T2R2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PDSS1Q5T2R2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDSS1Q5T2R2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDSS1Q5T2R2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDSS1Q5T2R2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PDSS1Q5T2R2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDSS1Q5T2R2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDSS1Q5T2R2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDSS1Q5T2R2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDSS1Q5T2R2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDSS1Q5T2R2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDSS1Q5T2R2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDSS1Q5T2R2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDSS1Q5T2R2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDSS1Q5T2R2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDSS1Q5T2R2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDSS1Q5T2R2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PDSS1Q5T2R2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDSS1Q5T2R2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDSS1Q5T2R2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDSS1Q5T2R2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDSS1Q5T2R2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDSS1Q5T2R2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDSS1Q5T2R2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDSS1Q5T2R2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDSS1Q5T2R2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDSS1Q5T2R2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDSS1Q5T2R2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDSS1Q5T2R2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDSS1Q5T2R2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDSS1Q5T2R2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDSS1Q5T2R2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDSS1Q5T2R2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDSS1Q5T2R2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDSS1Q5T2R2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDSS1Q5T2R2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDSS1Q5T2R2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDSS1Q5T2R2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDSS1Q5T2R2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDSS1Q5T2R2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDSS1Q5T2R2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDSS1Q5T2R2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDSS1Q5T2R2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDSS1Q5T2R2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDSS1Q5T2R2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDSS1Q5T2R2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDSS1Q5T2R2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDSS1Q5T2R2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDSS1Q5T2R2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PDSS1Q5T2R2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDSS1Q5T2R2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDSS1Q5T2R2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDSS1Q5T2R2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDSS1Q5T2R2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDSS1Q5T2R2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDSS1Q5T2R2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDSS1Q5T2R2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDSS1Q5T2R2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDSS1Q5T2R2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDSS1Q5T2R2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDSS1Q5T2R2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDSS1Q5T2R2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDSS1Q5T2R2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDSS1Q5T2R2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PDSS1Q5T2R2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDSS1Q5T2R2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDSS1Q5T2R2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PDSS1Q5T2R2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDSS1Q5T2R2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDSS1Q5T2R2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDSS1Q5T2R2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDSS1Q5T2R2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDSS1Q5T2R2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDSS1Q5T2R2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDSS1Q5T2R2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDSS1Q5T2R2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDSS1Q5T2R2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDSS1Q5T2R2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDSS1Q5T2R2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDSS1Q5T2R2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDSS1Q5T2R2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PDSS1Q5T2R2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDSS1Q5T2R2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDSS1Q5T2R2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PDSS1Q5T2R2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDSS1Q5T2R2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDSS1Q5T2R2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms