Protein–RNA interactions for Protein: Q5T1R4

HIVEP3, Transcription factor HIVEP3, humanhuman

Predictions only

Length 2,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIVEP3Q5T1R4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HIVEP3Q5T1R4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HIVEP3Q5T1R4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HIVEP3Q5T1R4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HIVEP3Q5T1R4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HIVEP3Q5T1R4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HIVEP3Q5T1R4 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HIVEP3Q5T1R4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HIVEP3Q5T1R4 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HIVEP3Q5T1R4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HIVEP3Q5T1R4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HIVEP3Q5T1R4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HIVEP3Q5T1R4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HIVEP3Q5T1R4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HIVEP3Q5T1R4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HIVEP3Q5T1R4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HIVEP3Q5T1R4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HIVEP3Q5T1R4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HIVEP3Q5T1R4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HIVEP3Q5T1R4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HIVEP3Q5T1R4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HIVEP3Q5T1R4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HIVEP3Q5T1R4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HIVEP3Q5T1R4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
HIVEP3Q5T1R4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
HIVEP3Q5T1R4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
HIVEP3Q5T1R4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HIVEP3Q5T1R4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HIVEP3Q5T1R4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HIVEP3Q5T1R4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HIVEP3Q5T1R4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HIVEP3Q5T1R4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HIVEP3Q5T1R4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HIVEP3Q5T1R4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HIVEP3Q5T1R4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HIVEP3Q5T1R4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HIVEP3Q5T1R4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HIVEP3Q5T1R4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HIVEP3Q5T1R4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HIVEP3Q5T1R4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HIVEP3Q5T1R4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
HIVEP3Q5T1R4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HIVEP3Q5T1R4 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HIVEP3Q5T1R4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HIVEP3Q5T1R4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIVEP3Q5T1R4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIVEP3Q5T1R4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIVEP3Q5T1R4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIVEP3Q5T1R4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HIVEP3Q5T1R4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HIVEP3Q5T1R4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HIVEP3Q5T1R4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HIVEP3Q5T1R4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HIVEP3Q5T1R4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HIVEP3Q5T1R4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HIVEP3Q5T1R4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HIVEP3Q5T1R4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HIVEP3Q5T1R4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HIVEP3Q5T1R4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HIVEP3Q5T1R4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HIVEP3Q5T1R4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HIVEP3Q5T1R4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HIVEP3Q5T1R4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HIVEP3Q5T1R4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HIVEP3Q5T1R4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HIVEP3Q5T1R4 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HIVEP3Q5T1R4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HIVEP3Q5T1R4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HIVEP3Q5T1R4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIVEP3Q5T1R4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIVEP3Q5T1R4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIVEP3Q5T1R4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIVEP3Q5T1R4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HIVEP3Q5T1R4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HIVEP3Q5T1R4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HIVEP3Q5T1R4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HIVEP3Q5T1R4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HIVEP3Q5T1R4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HIVEP3Q5T1R4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HIVEP3Q5T1R4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HIVEP3Q5T1R4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HIVEP3Q5T1R4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HIVEP3Q5T1R4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIVEP3Q5T1R4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIVEP3Q5T1R4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIVEP3Q5T1R4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HIVEP3Q5T1R4 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HIVEP3Q5T1R4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HIVEP3Q5T1R4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HIVEP3Q5T1R4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HIVEP3Q5T1R4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HIVEP3Q5T1R4 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HIVEP3Q5T1R4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HIVEP3Q5T1R4 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HIVEP3Q5T1R4 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HIVEP3Q5T1R4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HIVEP3Q5T1R4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HIVEP3Q5T1R4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HIVEP3Q5T1R4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HIVEP3Q5T1R4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.8 ms