Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
NHSL1Q5SYE7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC38.27■■■■□ 3.72
NHSL1Q5SYE7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
NHSL1Q5SYE7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC38.25■■■■□ 3.71
NHSL1Q5SYE7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
NHSL1Q5SYE7 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
NHSL1Q5SYE7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
NHSL1Q5SYE7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC38.2■■■■□ 3.71
NHSL1Q5SYE7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.71
NHSL1Q5SYE7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.7
NHSL1Q5SYE7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
NHSL1Q5SYE7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
NHSL1Q5SYE7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
NHSL1Q5SYE7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC38.17■■■■□ 3.7
NHSL1Q5SYE7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
NHSL1Q5SYE7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
NHSL1Q5SYE7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
NHSL1Q5SYE7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
NHSL1Q5SYE7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
NHSL1Q5SYE7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
NHSL1Q5SYE7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
NHSL1Q5SYE7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC38.08■■■■□ 3.69
NHSL1Q5SYE7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.69
NHSL1Q5SYE7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC38.07■■■■□ 3.68
NHSL1Q5SYE7 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
NHSL1Q5SYE7 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
NHSL1Q5SYE7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC38.04■■■■□ 3.68
NHSL1Q5SYE7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
NHSL1Q5SYE7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
NHSL1Q5SYE7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC38.01■■■■□ 3.67
NHSL1Q5SYE7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
NHSL1Q5SYE7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
NHSL1Q5SYE7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
NHSL1Q5SYE7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
NHSL1Q5SYE7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
NHSL1Q5SYE7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
NHSL1Q5SYE7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
NHSL1Q5SYE7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
NHSL1Q5SYE7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
NHSL1Q5SYE7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC37.96■■■■□ 3.67
NHSL1Q5SYE7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC37.95■■■■□ 3.67
NHSL1Q5SYE7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC37.95■■■■□ 3.67
NHSL1Q5SYE7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
NHSL1Q5SYE7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
NHSL1Q5SYE7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
NHSL1Q5SYE7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
NHSL1Q5SYE7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
NHSL1Q5SYE7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
NHSL1Q5SYE7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
NHSL1Q5SYE7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
NHSL1Q5SYE7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
NHSL1Q5SYE7 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.66
NHSL1Q5SYE7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
NHSL1Q5SYE7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
NHSL1Q5SYE7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
NHSL1Q5SYE7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
NHSL1Q5SYE7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
NHSL1Q5SYE7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
NHSL1Q5SYE7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
NHSL1Q5SYE7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC37.81■■■■□ 3.64
NHSL1Q5SYE7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
NHSL1Q5SYE7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
NHSL1Q5SYE7 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
NHSL1Q5SYE7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC37.78■■■■□ 3.64
NHSL1Q5SYE7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
NHSL1Q5SYE7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
NHSL1Q5SYE7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
NHSL1Q5SYE7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
NHSL1Q5SYE7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC37.7■■■■□ 3.63
NHSL1Q5SYE7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
NHSL1Q5SYE7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC37.69■■■■□ 3.62
NHSL1Q5SYE7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
NHSL1Q5SYE7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
NHSL1Q5SYE7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
NHSL1Q5SYE7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
NHSL1Q5SYE7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
NHSL1Q5SYE7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
NHSL1Q5SYE7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
NHSL1Q5SYE7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
NHSL1Q5SYE7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
NHSL1Q5SYE7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
NHSL1Q5SYE7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
NHSL1Q5SYE7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
NHSL1Q5SYE7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC37.62■■■■□ 3.61
NHSL1Q5SYE7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC37.62■■■■□ 3.61
NHSL1Q5SYE7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
NHSL1Q5SYE7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
NHSL1Q5SYE7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
NHSL1Q5SYE7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
NHSL1Q5SYE7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
NHSL1Q5SYE7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
NHSL1Q5SYE7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
NHSL1Q5SYE7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
NHSL1Q5SYE7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
NHSL1Q5SYE7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
NHSL1Q5SYE7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
NHSL1Q5SYE7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
NHSL1Q5SYE7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
NHSL1Q5SYE7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
NHSL1Q5SYE7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms