Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRD0

WASHC2D, WASH complex subunit 2D, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC2DQ5SRD0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
WASHC2DQ5SRD0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
WASHC2DQ5SRD0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
WASHC2DQ5SRD0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
WASHC2DQ5SRD0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
WASHC2DQ5SRD0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
WASHC2DQ5SRD0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
WASHC2DQ5SRD0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
WASHC2DQ5SRD0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
WASHC2DQ5SRD0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
WASHC2DQ5SRD0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
WASHC2DQ5SRD0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
WASHC2DQ5SRD0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
WASHC2DQ5SRD0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
WASHC2DQ5SRD0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
WASHC2DQ5SRD0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
WASHC2DQ5SRD0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
WASHC2DQ5SRD0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
WASHC2DQ5SRD0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
WASHC2DQ5SRD0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
WASHC2DQ5SRD0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
WASHC2DQ5SRD0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
WASHC2DQ5SRD0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
WASHC2DQ5SRD0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
WASHC2DQ5SRD0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
WASHC2DQ5SRD0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
WASHC2DQ5SRD0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
WASHC2DQ5SRD0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
WASHC2DQ5SRD0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
WASHC2DQ5SRD0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
WASHC2DQ5SRD0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
WASHC2DQ5SRD0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
WASHC2DQ5SRD0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
WASHC2DQ5SRD0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
WASHC2DQ5SRD0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
WASHC2DQ5SRD0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
WASHC2DQ5SRD0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
WASHC2DQ5SRD0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
WASHC2DQ5SRD0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
WASHC2DQ5SRD0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
WASHC2DQ5SRD0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
WASHC2DQ5SRD0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
WASHC2DQ5SRD0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
WASHC2DQ5SRD0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
WASHC2DQ5SRD0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
WASHC2DQ5SRD0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
WASHC2DQ5SRD0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
WASHC2DQ5SRD0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
WASHC2DQ5SRD0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
WASHC2DQ5SRD0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
WASHC2DQ5SRD0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
WASHC2DQ5SRD0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
WASHC2DQ5SRD0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
WASHC2DQ5SRD0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
WASHC2DQ5SRD0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
WASHC2DQ5SRD0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
WASHC2DQ5SRD0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
WASHC2DQ5SRD0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
WASHC2DQ5SRD0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
WASHC2DQ5SRD0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
WASHC2DQ5SRD0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
WASHC2DQ5SRD0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
WASHC2DQ5SRD0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
WASHC2DQ5SRD0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
WASHC2DQ5SRD0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
WASHC2DQ5SRD0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
WASHC2DQ5SRD0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
WASHC2DQ5SRD0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
WASHC2DQ5SRD0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
WASHC2DQ5SRD0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
WASHC2DQ5SRD0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
WASHC2DQ5SRD0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
WASHC2DQ5SRD0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
WASHC2DQ5SRD0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
WASHC2DQ5SRD0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
WASHC2DQ5SRD0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
WASHC2DQ5SRD0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
WASHC2DQ5SRD0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
WASHC2DQ5SRD0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
WASHC2DQ5SRD0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
WASHC2DQ5SRD0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
WASHC2DQ5SRD0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
WASHC2DQ5SRD0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
WASHC2DQ5SRD0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
WASHC2DQ5SRD0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
WASHC2DQ5SRD0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
WASHC2DQ5SRD0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
WASHC2DQ5SRD0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
WASHC2DQ5SRD0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
WASHC2DQ5SRD0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
WASHC2DQ5SRD0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
WASHC2DQ5SRD0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
WASHC2DQ5SRD0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
WASHC2DQ5SRD0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
WASHC2DQ5SRD0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
WASHC2DQ5SRD0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
WASHC2DQ5SRD0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
WASHC2DQ5SRD0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
WASHC2DQ5SRD0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
WASHC2DQ5SRD0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms