Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KCNT1Q5JUK3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KCNT1Q5JUK3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KCNT1Q5JUK3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KCNT1Q5JUK3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KCNT1Q5JUK3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KCNT1Q5JUK3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
KCNT1Q5JUK3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
KCNT1Q5JUK3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KCNT1Q5JUK3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KCNT1Q5JUK3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KCNT1Q5JUK3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KCNT1Q5JUK3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KCNT1Q5JUK3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KCNT1Q5JUK3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KCNT1Q5JUK3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KCNT1Q5JUK3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KCNT1Q5JUK3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KCNT1Q5JUK3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
KCNT1Q5JUK3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KCNT1Q5JUK3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KCNT1Q5JUK3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KCNT1Q5JUK3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KCNT1Q5JUK3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KCNT1Q5JUK3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KCNT1Q5JUK3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
KCNT1Q5JUK3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KCNT1Q5JUK3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KCNT1Q5JUK3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KCNT1Q5JUK3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
KCNT1Q5JUK3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KCNT1Q5JUK3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
KCNT1Q5JUK3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KCNT1Q5JUK3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KCNT1Q5JUK3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KCNT1Q5JUK3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KCNT1Q5JUK3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KCNT1Q5JUK3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KCNT1Q5JUK3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KCNT1Q5JUK3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KCNT1Q5JUK3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KCNT1Q5JUK3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
KCNT1Q5JUK3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
KCNT1Q5JUK3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KCNT1Q5JUK3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KCNT1Q5JUK3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KCNT1Q5JUK3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KCNT1Q5JUK3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KCNT1Q5JUK3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KCNT1Q5JUK3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KCNT1Q5JUK3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KCNT1Q5JUK3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KCNT1Q5JUK3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KCNT1Q5JUK3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
KCNT1Q5JUK3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
KCNT1Q5JUK3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KCNT1Q5JUK3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KCNT1Q5JUK3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KCNT1Q5JUK3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KCNT1Q5JUK3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KCNT1Q5JUK3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KCNT1Q5JUK3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KCNT1Q5JUK3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KCNT1Q5JUK3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KCNT1Q5JUK3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
KCNT1Q5JUK3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KCNT1Q5JUK3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KCNT1Q5JUK3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KCNT1Q5JUK3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KCNT1Q5JUK3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KCNT1Q5JUK3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
KCNT1Q5JUK3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KCNT1Q5JUK3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KCNT1Q5JUK3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KCNT1Q5JUK3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KCNT1Q5JUK3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KCNT1Q5JUK3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KCNT1Q5JUK3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KCNT1Q5JUK3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KCNT1Q5JUK3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KCNT1Q5JUK3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KCNT1Q5JUK3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KCNT1Q5JUK3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
KCNT1Q5JUK3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KCNT1Q5JUK3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KCNT1Q5JUK3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KCNT1Q5JUK3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KCNT1Q5JUK3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
KCNT1Q5JUK3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
KCNT1Q5JUK3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KCNT1Q5JUK3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KCNT1Q5JUK3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KCNT1Q5JUK3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KCNT1Q5JUK3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KCNT1Q5JUK3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KCNT1Q5JUK3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KCNT1Q5JUK3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
KCNT1Q5JUK3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KCNT1Q5JUK3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KCNT1Q5JUK3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms