Protein–RNA interactions for Protein: Q4G176

ACSF3, Acyl-CoA synthetase family member 3, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSF3Q4G176 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ACSF3Q4G176 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACSF3Q4G176 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACSF3Q4G176 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACSF3Q4G176 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACSF3Q4G176 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ACSF3Q4G176 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ACSF3Q4G176 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ACSF3Q4G176 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACSF3Q4G176 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACSF3Q4G176 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACSF3Q4G176 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACSF3Q4G176 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACSF3Q4G176 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ACSF3Q4G176 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACSF3Q4G176 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACSF3Q4G176 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ACSF3Q4G176 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ACSF3Q4G176 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACSF3Q4G176 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACSF3Q4G176 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ACSF3Q4G176 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACSF3Q4G176 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACSF3Q4G176 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACSF3Q4G176 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ACSF3Q4G176 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACSF3Q4G176 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ACSF3Q4G176 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACSF3Q4G176 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACSF3Q4G176 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACSF3Q4G176 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ACSF3Q4G176 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ACSF3Q4G176 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACSF3Q4G176 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ACSF3Q4G176 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACSF3Q4G176 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACSF3Q4G176 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ACSF3Q4G176 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ACSF3Q4G176 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACSF3Q4G176 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACSF3Q4G176 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ACSF3Q4G176 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ACSF3Q4G176 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACSF3Q4G176 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ACSF3Q4G176 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ACSF3Q4G176 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ACSF3Q4G176 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACSF3Q4G176 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACSF3Q4G176 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ACSF3Q4G176 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACSF3Q4G176 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACSF3Q4G176 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ACSF3Q4G176 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ACSF3Q4G176 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACSF3Q4G176 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACSF3Q4G176 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACSF3Q4G176 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACSF3Q4G176 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACSF3Q4G176 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACSF3Q4G176 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACSF3Q4G176 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACSF3Q4G176 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACSF3Q4G176 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACSF3Q4G176 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACSF3Q4G176 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACSF3Q4G176 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACSF3Q4G176 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACSF3Q4G176 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACSF3Q4G176 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ACSF3Q4G176 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACSF3Q4G176 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACSF3Q4G176 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACSF3Q4G176 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACSF3Q4G176 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ACSF3Q4G176 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACSF3Q4G176 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACSF3Q4G176 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACSF3Q4G176 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACSF3Q4G176 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACSF3Q4G176 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACSF3Q4G176 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACSF3Q4G176 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACSF3Q4G176 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACSF3Q4G176 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACSF3Q4G176 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACSF3Q4G176 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACSF3Q4G176 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACSF3Q4G176 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACSF3Q4G176 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACSF3Q4G176 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACSF3Q4G176 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACSF3Q4G176 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACSF3Q4G176 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACSF3Q4G176 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACSF3Q4G176 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACSF3Q4G176 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACSF3Q4G176 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACSF3Q4G176 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACSF3Q4G176 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ACSF3Q4G176 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms