Protein–RNA interactions for Protein: Q1EHB4

SLC5A12, Sodium-coupled monocarboxylate transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A12Q1EHB4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC5A12Q1EHB4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC5A12Q1EHB4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC5A12Q1EHB4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC5A12Q1EHB4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC5A12Q1EHB4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC5A12Q1EHB4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC5A12Q1EHB4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC5A12Q1EHB4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC5A12Q1EHB4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC5A12Q1EHB4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC5A12Q1EHB4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC5A12Q1EHB4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC5A12Q1EHB4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC5A12Q1EHB4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC5A12Q1EHB4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC5A12Q1EHB4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC5A12Q1EHB4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC5A12Q1EHB4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC5A12Q1EHB4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC5A12Q1EHB4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC5A12Q1EHB4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC5A12Q1EHB4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC5A12Q1EHB4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC5A12Q1EHB4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC5A12Q1EHB4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC5A12Q1EHB4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC5A12Q1EHB4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC5A12Q1EHB4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC5A12Q1EHB4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC5A12Q1EHB4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC5A12Q1EHB4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC5A12Q1EHB4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC5A12Q1EHB4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC5A12Q1EHB4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC5A12Q1EHB4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC5A12Q1EHB4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC5A12Q1EHB4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC5A12Q1EHB4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC5A12Q1EHB4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC5A12Q1EHB4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC5A12Q1EHB4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC5A12Q1EHB4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC5A12Q1EHB4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC5A12Q1EHB4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC5A12Q1EHB4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC5A12Q1EHB4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC5A12Q1EHB4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC5A12Q1EHB4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC5A12Q1EHB4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC5A12Q1EHB4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC5A12Q1EHB4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC5A12Q1EHB4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC5A12Q1EHB4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC5A12Q1EHB4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC5A12Q1EHB4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC5A12Q1EHB4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC5A12Q1EHB4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC5A12Q1EHB4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC5A12Q1EHB4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC5A12Q1EHB4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC5A12Q1EHB4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC5A12Q1EHB4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC5A12Q1EHB4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC5A12Q1EHB4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC5A12Q1EHB4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC5A12Q1EHB4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC5A12Q1EHB4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC5A12Q1EHB4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC5A12Q1EHB4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC5A12Q1EHB4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC5A12Q1EHB4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC5A12Q1EHB4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC5A12Q1EHB4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC5A12Q1EHB4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC5A12Q1EHB4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC5A12Q1EHB4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC5A12Q1EHB4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC5A12Q1EHB4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC5A12Q1EHB4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC5A12Q1EHB4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC5A12Q1EHB4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC5A12Q1EHB4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC5A12Q1EHB4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC5A12Q1EHB4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC5A12Q1EHB4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC5A12Q1EHB4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC5A12Q1EHB4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC5A12Q1EHB4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC5A12Q1EHB4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC5A12Q1EHB4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC5A12Q1EHB4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC5A12Q1EHB4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC5A12Q1EHB4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC5A12Q1EHB4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC5A12Q1EHB4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC5A12Q1EHB4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC5A12Q1EHB4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC5A12Q1EHB4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC5A12Q1EHB4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms