Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
EXT1Q16394 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EXT1Q16394 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EXT1Q16394 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EXT1Q16394 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EXT1Q16394 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EXT1Q16394 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EXT1Q16394 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
EXT1Q16394 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EXT1Q16394 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EXT1Q16394 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
EXT1Q16394 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EXT1Q16394 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EXT1Q16394 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EXT1Q16394 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EXT1Q16394 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EXT1Q16394 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EXT1Q16394 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EXT1Q16394 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
EXT1Q16394 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EXT1Q16394 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EXT1Q16394 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EXT1Q16394 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EXT1Q16394 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EXT1Q16394 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EXT1Q16394 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EXT1Q16394 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
EXT1Q16394 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EXT1Q16394 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EXT1Q16394 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EXT1Q16394 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EXT1Q16394 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EXT1Q16394 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
EXT1Q16394 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EXT1Q16394 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EXT1Q16394 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
EXT1Q16394 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EXT1Q16394 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EXT1Q16394 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EXT1Q16394 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EXT1Q16394 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EXT1Q16394 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EXT1Q16394 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EXT1Q16394 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EXT1Q16394 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EXT1Q16394 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EXT1Q16394 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EXT1Q16394 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EXT1Q16394 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
EXT1Q16394 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EXT1Q16394 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EXT1Q16394 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EXT1Q16394 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EXT1Q16394 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EXT1Q16394 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
EXT1Q16394 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EXT1Q16394 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EXT1Q16394 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EXT1Q16394 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EXT1Q16394 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
EXT1Q16394 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
EXT1Q16394 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EXT1Q16394 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EXT1Q16394 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EXT1Q16394 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EXT1Q16394 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EXT1Q16394 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EXT1Q16394 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EXT1Q16394 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EXT1Q16394 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EXT1Q16394 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EXT1Q16394 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EXT1Q16394 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EXT1Q16394 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EXT1Q16394 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EXT1Q16394 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EXT1Q16394 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EXT1Q16394 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EXT1Q16394 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EXT1Q16394 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EXT1Q16394 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EXT1Q16394 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EXT1Q16394 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EXT1Q16394 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EXT1Q16394 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EXT1Q16394 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EXT1Q16394 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EXT1Q16394 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EXT1Q16394 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EXT1Q16394 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EXT1Q16394 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EXT1Q16394 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EXT1Q16394 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EXT1Q16394 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EXT1Q16394 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EXT1Q16394 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EXT1Q16394 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EXT1Q16394 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EXT1Q16394 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EXT1Q16394 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 190.2 ms