Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAB39AQ14964 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB39AQ14964 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAB39AQ14964 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB39AQ14964 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB39AQ14964 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB39AQ14964 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB39AQ14964 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAB39AQ14964 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB39AQ14964 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RAB39AQ14964 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RAB39AQ14964 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB39AQ14964 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB39AQ14964 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB39AQ14964 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB39AQ14964 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB39AQ14964 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB39AQ14964 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB39AQ14964 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB39AQ14964 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB39AQ14964 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB39AQ14964 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB39AQ14964 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB39AQ14964 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB39AQ14964 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB39AQ14964 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB39AQ14964 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB39AQ14964 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB39AQ14964 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB39AQ14964 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB39AQ14964 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB39AQ14964 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB39AQ14964 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB39AQ14964 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB39AQ14964 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB39AQ14964 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB39AQ14964 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB39AQ14964 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB39AQ14964 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB39AQ14964 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB39AQ14964 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB39AQ14964 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB39AQ14964 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB39AQ14964 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB39AQ14964 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB39AQ14964 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB39AQ14964 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB39AQ14964 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB39AQ14964 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RAB39AQ14964 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB39AQ14964 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB39AQ14964 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB39AQ14964 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB39AQ14964 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB39AQ14964 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB39AQ14964 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB39AQ14964 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB39AQ14964 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB39AQ14964 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB39AQ14964 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB39AQ14964 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB39AQ14964 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB39AQ14964 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB39AQ14964 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB39AQ14964 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB39AQ14964 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB39AQ14964 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB39AQ14964 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB39AQ14964 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB39AQ14964 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB39AQ14964 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB39AQ14964 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB39AQ14964 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB39AQ14964 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB39AQ14964 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB39AQ14964 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB39AQ14964 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB39AQ14964 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB39AQ14964 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB39AQ14964 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB39AQ14964 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB39AQ14964 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAB39AQ14964 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAB39AQ14964 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAB39AQ14964 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB39AQ14964 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB39AQ14964 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB39AQ14964 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAB39AQ14964 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB39AQ14964 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB39AQ14964 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB39AQ14964 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB39AQ14964 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB39AQ14964 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB39AQ14964 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB39AQ14964 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB39AQ14964 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB39AQ14964 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAB39AQ14964 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RAB39AQ14964 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
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