Protein–RNA interactions for Protein: Q13522

PPP1R1A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1A, humanhuman

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Length 171 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R1AQ13522 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP1R1AQ13522 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP1R1AQ13522 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP1R1AQ13522 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP1R1AQ13522 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP1R1AQ13522 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP1R1AQ13522 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PPP1R1AQ13522 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP1R1AQ13522 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP1R1AQ13522 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP1R1AQ13522 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP1R1AQ13522 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP1R1AQ13522 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP1R1AQ13522 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP1R1AQ13522 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP1R1AQ13522 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP1R1AQ13522 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP1R1AQ13522 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP1R1AQ13522 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PPP1R1AQ13522 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPP1R1AQ13522 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPP1R1AQ13522 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPP1R1AQ13522 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP1R1AQ13522 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP1R1AQ13522 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP1R1AQ13522 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP1R1AQ13522 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP1R1AQ13522 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP1R1AQ13522 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP1R1AQ13522 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP1R1AQ13522 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP1R1AQ13522 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP1R1AQ13522 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP1R1AQ13522 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP1R1AQ13522 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPP1R1AQ13522 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPP1R1AQ13522 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPP1R1AQ13522 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PPP1R1AQ13522 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPP1R1AQ13522 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPP1R1AQ13522 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PPP1R1AQ13522 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPP1R1AQ13522 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PPP1R1AQ13522 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPP1R1AQ13522 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPP1R1AQ13522 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PPP1R1AQ13522 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPP1R1AQ13522 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PPP1R1AQ13522 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP1R1AQ13522 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP1R1AQ13522 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP1R1AQ13522 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPP1R1AQ13522 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPP1R1AQ13522 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPP1R1AQ13522 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PPP1R1AQ13522 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP1R1AQ13522 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPP1R1AQ13522 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP1R1AQ13522 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP1R1AQ13522 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPP1R1AQ13522 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP1R1AQ13522 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP1R1AQ13522 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP1R1AQ13522 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP1R1AQ13522 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PPP1R1AQ13522 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP1R1AQ13522 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP1R1AQ13522 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPP1R1AQ13522 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PPP1R1AQ13522 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP1R1AQ13522 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPP1R1AQ13522 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP1R1AQ13522 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP1R1AQ13522 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPP1R1AQ13522 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP1R1AQ13522 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP1R1AQ13522 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPP1R1AQ13522 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP1R1AQ13522 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP1R1AQ13522 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPP1R1AQ13522 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP1R1AQ13522 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP1R1AQ13522 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP1R1AQ13522 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPP1R1AQ13522 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP1R1AQ13522 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP1R1AQ13522 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP1R1AQ13522 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP1R1AQ13522 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP1R1AQ13522 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP1R1AQ13522 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPP1R1AQ13522 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPP1R1AQ13522 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPP1R1AQ13522 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPP1R1AQ13522 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPP1R1AQ13522 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP1R1AQ13522 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP1R1AQ13522 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPP1R1AQ13522 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPP1R1AQ13522 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
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