Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IKZF1Q13422 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IKZF1Q13422 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IKZF1Q13422 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IKZF1Q13422 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IKZF1Q13422 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IKZF1Q13422 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IKZF1Q13422 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IKZF1Q13422 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
IKZF1Q13422 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
IKZF1Q13422 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
IKZF1Q13422 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IKZF1Q13422 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IKZF1Q13422 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IKZF1Q13422 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IKZF1Q13422 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
IKZF1Q13422 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IKZF1Q13422 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IKZF1Q13422 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IKZF1Q13422 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IKZF1Q13422 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IKZF1Q13422 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IKZF1Q13422 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IKZF1Q13422 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IKZF1Q13422 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IKZF1Q13422 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IKZF1Q13422 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IKZF1Q13422 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
IKZF1Q13422 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IKZF1Q13422 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IKZF1Q13422 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IKZF1Q13422 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IKZF1Q13422 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IKZF1Q13422 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IKZF1Q13422 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IKZF1Q13422 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IKZF1Q13422 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IKZF1Q13422 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IKZF1Q13422 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IKZF1Q13422 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IKZF1Q13422 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IKZF1Q13422 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IKZF1Q13422 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IKZF1Q13422 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IKZF1Q13422 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IKZF1Q13422 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IKZF1Q13422 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IKZF1Q13422 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IKZF1Q13422 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IKZF1Q13422 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
IKZF1Q13422 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IKZF1Q13422 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IKZF1Q13422 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IKZF1Q13422 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IKZF1Q13422 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
IKZF1Q13422 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IKZF1Q13422 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IKZF1Q13422 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IKZF1Q13422 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IKZF1Q13422 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IKZF1Q13422 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IKZF1Q13422 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IKZF1Q13422 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IKZF1Q13422 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IKZF1Q13422 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IKZF1Q13422 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IKZF1Q13422 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
IKZF1Q13422 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IKZF1Q13422 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IKZF1Q13422 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
IKZF1Q13422 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IKZF1Q13422 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IKZF1Q13422 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IKZF1Q13422 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
IKZF1Q13422 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
IKZF1Q13422 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IKZF1Q13422 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IKZF1Q13422 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IKZF1Q13422 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IKZF1Q13422 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IKZF1Q13422 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IKZF1Q13422 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IKZF1Q13422 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IKZF1Q13422 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IKZF1Q13422 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IKZF1Q13422 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IKZF1Q13422 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IKZF1Q13422 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IKZF1Q13422 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IKZF1Q13422 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IKZF1Q13422 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IKZF1Q13422 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IKZF1Q13422 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IKZF1Q13422 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
IKZF1Q13422 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IKZF1Q13422 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IKZF1Q13422 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IKZF1Q13422 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IKZF1Q13422 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IKZF1Q13422 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
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