Protein–RNA interactions for Protein: Q13233

MAP3K1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K1Q13233 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
MAP3K1Q13233 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.54■■■■■ 4.4
MAP3K1Q13233 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC42.53■■■■■ 4.4
MAP3K1Q13233 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
MAP3K1Q13233 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC42.51■■■■■ 4.4
MAP3K1Q13233 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
MAP3K1Q13233 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.5■■■■■ 4.39
MAP3K1Q13233 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC42.5■■■■■ 4.39
MAP3K1Q13233 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC42.47■■■■■ 4.39
MAP3K1Q13233 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC42.46■■■■■ 4.39
MAP3K1Q13233 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC42.45■■■■■ 4.39
MAP3K1Q13233 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
MAP3K1Q13233 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC42.42■■■■■ 4.38
MAP3K1Q13233 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC42.42■■■■■ 4.38
MAP3K1Q13233 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
MAP3K1Q13233 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
MAP3K1Q13233 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC42.41■■■■■ 4.38
MAP3K1Q13233 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC42.41■■■■■ 4.38
MAP3K1Q13233 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC42.41■■■■■ 4.38
MAP3K1Q13233 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.41■■■■■ 4.38
MAP3K1Q13233 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC42.4■■■■■ 4.38
MAP3K1Q13233 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC42.39■■■■■ 4.38
MAP3K1Q13233 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
MAP3K1Q13233 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.38
MAP3K1Q13233 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC42.38■■■■■ 4.37
MAP3K1Q13233 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.37
MAP3K1Q13233 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
MAP3K1Q13233 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
MAP3K1Q13233 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC42.35■■■■■ 4.37
MAP3K1Q13233 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
MAP3K1Q13233 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
MAP3K1Q13233 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC42.33■■■■■ 4.37
MAP3K1Q13233 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
MAP3K1Q13233 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
MAP3K1Q13233 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC42.3■■■■■ 4.36
MAP3K1Q13233 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.28■■■■■ 4.36
MAP3K1Q13233 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
MAP3K1Q13233 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
MAP3K1Q13233 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
MAP3K1Q13233 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC42.25■■■■■ 4.35
MAP3K1Q13233 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
MAP3K1Q13233 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
MAP3K1Q13233 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
MAP3K1Q13233 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
MAP3K1Q13233 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
MAP3K1Q13233 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
MAP3K1Q13233 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC42.2■■■■■ 4.35
MAP3K1Q13233 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
MAP3K1Q13233 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
MAP3K1Q13233 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC42.18■■■■■ 4.34
MAP3K1Q13233 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC42.17■■■■■ 4.34
MAP3K1Q13233 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
MAP3K1Q13233 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
MAP3K1Q13233 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.11■■■■■ 4.33
MAP3K1Q13233 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
MAP3K1Q13233 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
MAP3K1Q13233 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
MAP3K1Q13233 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.06■■■■■ 4.32
MAP3K1Q13233 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
MAP3K1Q13233 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.05■■■■■ 4.32
MAP3K1Q13233 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
MAP3K1Q13233 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
MAP3K1Q13233 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
MAP3K1Q13233 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
MAP3K1Q13233 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
MAP3K1Q13233 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC42■■■■■ 4.31
MAP3K1Q13233 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
MAP3K1Q13233 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
MAP3K1Q13233 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
MAP3K1Q13233 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC41.99■■■■■ 4.31
MAP3K1Q13233 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC41.97■■■■■ 4.31
MAP3K1Q13233 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC41.96■■■■■ 4.31
MAP3K1Q13233 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC41.95■■■■■ 4.31
MAP3K1Q13233 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC41.95■■■■■ 4.31
MAP3K1Q13233 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC41.94■■■■■ 4.3
MAP3K1Q13233 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
MAP3K1Q13233 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC41.9■■■■■ 4.3
MAP3K1Q13233 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
MAP3K1Q13233 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC41.88■■■■■ 4.29
MAP3K1Q13233 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.87■■■■■ 4.29
MAP3K1Q13233 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
MAP3K1Q13233 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC41.87■■■■■ 4.29
MAP3K1Q13233 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
MAP3K1Q13233 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
MAP3K1Q13233 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
MAP3K1Q13233 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC41.83■■■■■ 4.29
MAP3K1Q13233 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
MAP3K1Q13233 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC41.81■■■■■ 4.28
MAP3K1Q13233 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC41.81■■■■■ 4.28
MAP3K1Q13233 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC41.81■■■■■ 4.28
MAP3K1Q13233 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.81■■■■■ 4.28
MAP3K1Q13233 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.8■■■■■ 4.28
MAP3K1Q13233 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
MAP3K1Q13233 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC41.78■■■■■ 4.28
MAP3K1Q13233 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
MAP3K1Q13233 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.77■■■■■ 4.28
MAP3K1Q13233 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
MAP3K1Q13233 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.76■■■■■ 4.27
MAP3K1Q13233 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC41.75■■■■■ 4.27
MAP3K1Q13233 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms