Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GRIK3Q13003 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GRIK3Q13003 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GRIK3Q13003 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GRIK3Q13003 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GRIK3Q13003 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GRIK3Q13003 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
GRIK3Q13003 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
GRIK3Q13003 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GRIK3Q13003 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GRIK3Q13003 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GRIK3Q13003 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GRIK3Q13003 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GRIK3Q13003 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GRIK3Q13003 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
GRIK3Q13003 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
GRIK3Q13003 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
GRIK3Q13003 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
GRIK3Q13003 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
GRIK3Q13003 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GRIK3Q13003 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GRIK3Q13003 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GRIK3Q13003 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GRIK3Q13003 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
GRIK3Q13003 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GRIK3Q13003 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GRIK3Q13003 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GRIK3Q13003 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GRIK3Q13003 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GRIK3Q13003 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GRIK3Q13003 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GRIK3Q13003 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GRIK3Q13003 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GRIK3Q13003 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GRIK3Q13003 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GRIK3Q13003 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GRIK3Q13003 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GRIK3Q13003 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GRIK3Q13003 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GRIK3Q13003 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
GRIK3Q13003 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GRIK3Q13003 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GRIK3Q13003 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GRIK3Q13003 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
GRIK3Q13003 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GRIK3Q13003 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GRIK3Q13003 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
GRIK3Q13003 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
GRIK3Q13003 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GRIK3Q13003 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GRIK3Q13003 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GRIK3Q13003 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GRIK3Q13003 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GRIK3Q13003 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GRIK3Q13003 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GRIK3Q13003 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GRIK3Q13003 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GRIK3Q13003 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GRIK3Q13003 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GRIK3Q13003 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GRIK3Q13003 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GRIK3Q13003 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GRIK3Q13003 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GRIK3Q13003 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GRIK3Q13003 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GRIK3Q13003 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GRIK3Q13003 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GRIK3Q13003 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GRIK3Q13003 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GRIK3Q13003 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GRIK3Q13003 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GRIK3Q13003 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GRIK3Q13003 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GRIK3Q13003 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GRIK3Q13003 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GRIK3Q13003 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
GRIK3Q13003 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GRIK3Q13003 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GRIK3Q13003 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GRIK3Q13003 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GRIK3Q13003 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GRIK3Q13003 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GRIK3Q13003 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GRIK3Q13003 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
GRIK3Q13003 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
GRIK3Q13003 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GRIK3Q13003 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GRIK3Q13003 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GRIK3Q13003 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GRIK3Q13003 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GRIK3Q13003 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GRIK3Q13003 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GRIK3Q13003 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
GRIK3Q13003 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GRIK3Q13003 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
GRIK3Q13003 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
GRIK3Q13003 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GRIK3Q13003 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GRIK3Q13003 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GRIK3Q13003 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
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