Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
CGNL1Q0VF96 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
CGNL1Q0VF96 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
CGNL1Q0VF96 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
CGNL1Q0VF96 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
CGNL1Q0VF96 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
CGNL1Q0VF96 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
CGNL1Q0VF96 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
CGNL1Q0VF96 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
CGNL1Q0VF96 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
CGNL1Q0VF96 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
CGNL1Q0VF96 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
CGNL1Q0VF96 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC37.17■■■■□ 3.54
CGNL1Q0VF96 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
CGNL1Q0VF96 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
CGNL1Q0VF96 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
CGNL1Q0VF96 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
CGNL1Q0VF96 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
CGNL1Q0VF96 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC37.12■■■■□ 3.53
CGNL1Q0VF96 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
CGNL1Q0VF96 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
CGNL1Q0VF96 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC37.1■■■■□ 3.53
CGNL1Q0VF96 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
CGNL1Q0VF96 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
CGNL1Q0VF96 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
CGNL1Q0VF96 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC37.09■■■■□ 3.53
CGNL1Q0VF96 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
CGNL1Q0VF96 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
CGNL1Q0VF96 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
CGNL1Q0VF96 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
CGNL1Q0VF96 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
CGNL1Q0VF96 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
CGNL1Q0VF96 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
CGNL1Q0VF96 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
CGNL1Q0VF96 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC37■■■■□ 3.51
CGNL1Q0VF96 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
CGNL1Q0VF96 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
CGNL1Q0VF96 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
CGNL1Q0VF96 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
CGNL1Q0VF96 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
CGNL1Q0VF96 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC36.96■■■■□ 3.51
CGNL1Q0VF96 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
CGNL1Q0VF96 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
CGNL1Q0VF96 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
CGNL1Q0VF96 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
CGNL1Q0VF96 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
CGNL1Q0VF96 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
CGNL1Q0VF96 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
CGNL1Q0VF96 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
CGNL1Q0VF96 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
CGNL1Q0VF96 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
CGNL1Q0VF96 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
CGNL1Q0VF96 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
CGNL1Q0VF96 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
CGNL1Q0VF96 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
CGNL1Q0VF96 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
CGNL1Q0VF96 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
CGNL1Q0VF96 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
CGNL1Q0VF96 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC36.83■■■■□ 3.49
CGNL1Q0VF96 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
CGNL1Q0VF96 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
CGNL1Q0VF96 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
CGNL1Q0VF96 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
CGNL1Q0VF96 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
CGNL1Q0VF96 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
CGNL1Q0VF96 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
CGNL1Q0VF96 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
CGNL1Q0VF96 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
CGNL1Q0VF96 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
CGNL1Q0VF96 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
CGNL1Q0VF96 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
CGNL1Q0VF96 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
CGNL1Q0VF96 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.47
CGNL1Q0VF96 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
CGNL1Q0VF96 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CGNL1Q0VF96 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
CGNL1Q0VF96 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
CGNL1Q0VF96 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
CGNL1Q0VF96 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
CGNL1Q0VF96 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
CGNL1Q0VF96 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
CGNL1Q0VF96 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
CGNL1Q0VF96 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC36.67■■■■□ 3.46
CGNL1Q0VF96 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC36.67■■■■□ 3.46
CGNL1Q0VF96 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
CGNL1Q0VF96 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
CGNL1Q0VF96 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
CGNL1Q0VF96 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
CGNL1Q0VF96 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CGNL1Q0VF96 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
CGNL1Q0VF96 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
CGNL1Q0VF96 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CGNL1Q0VF96 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CGNL1Q0VF96 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CGNL1Q0VF96 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
CGNL1Q0VF96 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
CGNL1Q0VF96 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
CGNL1Q0VF96 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
CGNL1Q0VF96 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.45
CGNL1Q0VF96 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159.4 ms