Protein–RNA interactions for Protein: Q02543

RPL18A, 60S ribosomal protein L18a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL18AQ02543 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPL18AQ02543 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPL18AQ02543 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPL18AQ02543 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPL18AQ02543 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPL18AQ02543 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPL18AQ02543 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPL18AQ02543 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
RPL18AQ02543 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPL18AQ02543 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPL18AQ02543 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPL18AQ02543 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPL18AQ02543 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPL18AQ02543 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPL18AQ02543 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL18AQ02543 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL18AQ02543 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL18AQ02543 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPL18AQ02543 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPL18AQ02543 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPL18AQ02543 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPL18AQ02543 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL18AQ02543 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL18AQ02543 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL18AQ02543 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL18AQ02543 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPL18AQ02543 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPL18AQ02543 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL18AQ02543 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL18AQ02543 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL18AQ02543 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL18AQ02543 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL18AQ02543 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL18AQ02543 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL18AQ02543 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL18AQ02543 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL18AQ02543 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL18AQ02543 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL18AQ02543 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL18AQ02543 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL18AQ02543 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL18AQ02543 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL18AQ02543 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL18AQ02543 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPL18AQ02543 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPL18AQ02543 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPL18AQ02543 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPL18AQ02543 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
RPL18AQ02543 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RPL18AQ02543 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL18AQ02543 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL18AQ02543 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL18AQ02543 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL18AQ02543 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL18AQ02543 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RPL18AQ02543 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL18AQ02543 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL18AQ02543 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL18AQ02543 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL18AQ02543 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RPL18AQ02543 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL18AQ02543 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RPL18AQ02543 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL18AQ02543 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RPL18AQ02543 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RPL18AQ02543 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
RPL18AQ02543 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPL18AQ02543 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPL18AQ02543 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RPL18AQ02543 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL18AQ02543 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RPL18AQ02543 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL18AQ02543 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL18AQ02543 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL18AQ02543 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RPL18AQ02543 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPL18AQ02543 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPL18AQ02543 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPL18AQ02543 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPL18AQ02543 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RPL18AQ02543 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPL18AQ02543 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPL18AQ02543 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPL18AQ02543 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPL18AQ02543 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPL18AQ02543 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RPL18AQ02543 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPL18AQ02543 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPL18AQ02543 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPL18AQ02543 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
RPL18AQ02543 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPL18AQ02543 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPL18AQ02543 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPL18AQ02543 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPL18AQ02543 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPL18AQ02543 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPL18AQ02543 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPL18AQ02543 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPL18AQ02543 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPL18AQ02543 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms