Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PITPNAQ00169 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PITPNAQ00169 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PITPNAQ00169 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PITPNAQ00169 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PITPNAQ00169 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PITPNAQ00169 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PITPNAQ00169 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PITPNAQ00169 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PITPNAQ00169 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PITPNAQ00169 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PITPNAQ00169 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PITPNAQ00169 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PITPNAQ00169 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PITPNAQ00169 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PITPNAQ00169 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PITPNAQ00169 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PITPNAQ00169 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PITPNAQ00169 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PITPNAQ00169 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PITPNAQ00169 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PITPNAQ00169 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PITPNAQ00169 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PITPNAQ00169 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PITPNAQ00169 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PITPNAQ00169 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PITPNAQ00169 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PITPNAQ00169 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PITPNAQ00169 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PITPNAQ00169 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PITPNAQ00169 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PITPNAQ00169 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PITPNAQ00169 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PITPNAQ00169 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PITPNAQ00169 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PITPNAQ00169 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PITPNAQ00169 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PITPNAQ00169 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PITPNAQ00169 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PITPNAQ00169 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PITPNAQ00169 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PITPNAQ00169 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PITPNAQ00169 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PITPNAQ00169 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PITPNAQ00169 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PITPNAQ00169 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PITPNAQ00169 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PITPNAQ00169 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PITPNAQ00169 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PITPNAQ00169 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PITPNAQ00169 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PITPNAQ00169 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PITPNAQ00169 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PITPNAQ00169 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PITPNAQ00169 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PITPNAQ00169 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PITPNAQ00169 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PITPNAQ00169 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PITPNAQ00169 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PITPNAQ00169 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PITPNAQ00169 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PITPNAQ00169 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PITPNAQ00169 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PITPNAQ00169 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PITPNAQ00169 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PITPNAQ00169 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PITPNAQ00169 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PITPNAQ00169 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PITPNAQ00169 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PITPNAQ00169 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PITPNAQ00169 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PITPNAQ00169 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PITPNAQ00169 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PITPNAQ00169 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PITPNAQ00169 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PITPNAQ00169 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PITPNAQ00169 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PITPNAQ00169 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PITPNAQ00169 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PITPNAQ00169 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PITPNAQ00169 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PITPNAQ00169 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PITPNAQ00169 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PITPNAQ00169 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PITPNAQ00169 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PITPNAQ00169 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PITPNAQ00169 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PITPNAQ00169 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PITPNAQ00169 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PITPNAQ00169 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PITPNAQ00169 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PITPNAQ00169 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PITPNAQ00169 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PITPNAQ00169 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PITPNAQ00169 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PITPNAQ00169 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PITPNAQ00169 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PITPNAQ00169 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PITPNAQ00169 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PITPNAQ00169 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms