Protein–RNA interactions for Protein: P67809

YBX1, Nuclease-sensitive element-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX1P67809 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
YBX1P67809 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
YBX1P67809 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
YBX1P67809 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
YBX1P67809 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
YBX1P67809 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
YBX1P67809 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
YBX1P67809 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
YBX1P67809 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
YBX1P67809 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
YBX1P67809 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
YBX1P67809 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
YBX1P67809 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
YBX1P67809 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
YBX1P67809 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
YBX1P67809 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
YBX1P67809 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
YBX1P67809 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
YBX1P67809 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
YBX1P67809 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
YBX1P67809 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
YBX1P67809 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
YBX1P67809 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
YBX1P67809 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
YBX1P67809 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
YBX1P67809 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
YBX1P67809 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
YBX1P67809 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
YBX1P67809 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
YBX1P67809 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
YBX1P67809 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
YBX1P67809 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
YBX1P67809 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
YBX1P67809 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
YBX1P67809 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
YBX1P67809 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
YBX1P67809 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
YBX1P67809 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
YBX1P67809 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
YBX1P67809 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
YBX1P67809 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
YBX1P67809 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
YBX1P67809 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
YBX1P67809 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
YBX1P67809 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
YBX1P67809 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
YBX1P67809 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
YBX1P67809 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
YBX1P67809 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
YBX1P67809 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
YBX1P67809 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
YBX1P67809 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
YBX1P67809 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
YBX1P67809 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
YBX1P67809 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
YBX1P67809 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
YBX1P67809 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
YBX1P67809 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
YBX1P67809 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
YBX1P67809 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
YBX1P67809 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
YBX1P67809 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
YBX1P67809 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
YBX1P67809 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
YBX1P67809 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
YBX1P67809 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
YBX1P67809 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
YBX1P67809 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
YBX1P67809 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
YBX1P67809 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
YBX1P67809 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
YBX1P67809 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
YBX1P67809 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
YBX1P67809 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
YBX1P67809 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
YBX1P67809 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
YBX1P67809 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
YBX1P67809 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
YBX1P67809 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
YBX1P67809 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
YBX1P67809 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
YBX1P67809 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
YBX1P67809 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
YBX1P67809 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
YBX1P67809 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
YBX1P67809 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
YBX1P67809 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
YBX1P67809 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
YBX1P67809 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
YBX1P67809 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
YBX1P67809 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
YBX1P67809 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
YBX1P67809 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
YBX1P67809 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
YBX1P67809 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
YBX1P67809 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
YBX1P67809 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
YBX1P67809 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
YBX1P67809 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
YBX1P67809 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms