Protein–RNA interactions for Protein: P61011

SRP54, Signal recognition particle 54 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54P61011 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SRP54P61011 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SRP54P61011 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SRP54P61011 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SRP54P61011 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SRP54P61011 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRP54P61011 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRP54P61011 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SRP54P61011 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SRP54P61011 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SRP54P61011 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRP54P61011 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SRP54P61011 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SRP54P61011 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SRP54P61011 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SRP54P61011 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SRP54P61011 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SRP54P61011 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SRP54P61011 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SRP54P61011 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SRP54P61011 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SRP54P61011 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SRP54P61011 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SRP54P61011 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SRP54P61011 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SRP54P61011 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SRP54P61011 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SRP54P61011 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SRP54P61011 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SRP54P61011 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SRP54P61011 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SRP54P61011 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SRP54P61011 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SRP54P61011 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SRP54P61011 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SRP54P61011 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SRP54P61011 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SRP54P61011 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SRP54P61011 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SRP54P61011 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SRP54P61011 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SRP54P61011 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SRP54P61011 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SRP54P61011 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SRP54P61011 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SRP54P61011 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SRP54P61011 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SRP54P61011 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SRP54P61011 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SRP54P61011 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SRP54P61011 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SRP54P61011 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SRP54P61011 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SRP54P61011 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SRP54P61011 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SRP54P61011 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SRP54P61011 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SRP54P61011 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SRP54P61011 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SRP54P61011 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SRP54P61011 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SRP54P61011 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SRP54P61011 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SRP54P61011 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SRP54P61011 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SRP54P61011 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SRP54P61011 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SRP54P61011 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SRP54P61011 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SRP54P61011 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SRP54P61011 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SRP54P61011 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SRP54P61011 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SRP54P61011 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SRP54P61011 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SRP54P61011 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SRP54P61011 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SRP54P61011 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SRP54P61011 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SRP54P61011 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SRP54P61011 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SRP54P61011 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SRP54P61011 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SRP54P61011 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SRP54P61011 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SRP54P61011 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SRP54P61011 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SRP54P61011 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SRP54P61011 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SRP54P61011 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SRP54P61011 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SRP54P61011 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SRP54P61011 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SRP54P61011 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SRP54P61011 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SRP54P61011 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SRP54P61011 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SRP54P61011 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SRP54P61011 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SRP54P61011 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms