Protein–RNA interactions for Protein: P60411

KRTAP10-9, Keratin-associated protein 10-9, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP10-9P60411 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRTAP10-9P60411 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KRTAP10-9P60411 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KRTAP10-9P60411 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KRTAP10-9P60411 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
KRTAP10-9P60411 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRTAP10-9P60411 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRTAP10-9P60411 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRTAP10-9P60411 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRTAP10-9P60411 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRTAP10-9P60411 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KRTAP10-9P60411 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRTAP10-9P60411 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRTAP10-9P60411 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRTAP10-9P60411 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRTAP10-9P60411 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRTAP10-9P60411 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRTAP10-9P60411 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRTAP10-9P60411 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
KRTAP10-9P60411 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRTAP10-9P60411 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRTAP10-9P60411 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRTAP10-9P60411 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRTAP10-9P60411 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KRTAP10-9P60411 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRTAP10-9P60411 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRTAP10-9P60411 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRTAP10-9P60411 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRTAP10-9P60411 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRTAP10-9P60411 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRTAP10-9P60411 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRTAP10-9P60411 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRTAP10-9P60411 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
KRTAP10-9P60411 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRTAP10-9P60411 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRTAP10-9P60411 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRTAP10-9P60411 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRTAP10-9P60411 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRTAP10-9P60411 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRTAP10-9P60411 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRTAP10-9P60411 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
KRTAP10-9P60411 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
KRTAP10-9P60411 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
KRTAP10-9P60411 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRTAP10-9P60411 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRTAP10-9P60411 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRTAP10-9P60411 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRTAP10-9P60411 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRTAP10-9P60411 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRTAP10-9P60411 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRTAP10-9P60411 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRTAP10-9P60411 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRTAP10-9P60411 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRTAP10-9P60411 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRTAP10-9P60411 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRTAP10-9P60411 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRTAP10-9P60411 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRTAP10-9P60411 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRTAP10-9P60411 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRTAP10-9P60411 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRTAP10-9P60411 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRTAP10-9P60411 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KRTAP10-9P60411 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRTAP10-9P60411 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRTAP10-9P60411 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
KRTAP10-9P60411 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRTAP10-9P60411 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRTAP10-9P60411 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRTAP10-9P60411 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KRTAP10-9P60411 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KRTAP10-9P60411 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KRTAP10-9P60411 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRTAP10-9P60411 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRTAP10-9P60411 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRTAP10-9P60411 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRTAP10-9P60411 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
KRTAP10-9P60411 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRTAP10-9P60411 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRTAP10-9P60411 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRTAP10-9P60411 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRTAP10-9P60411 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRTAP10-9P60411 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRTAP10-9P60411 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRTAP10-9P60411 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRTAP10-9P60411 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRTAP10-9P60411 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRTAP10-9P60411 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRTAP10-9P60411 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KRTAP10-9P60411 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRTAP10-9P60411 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRTAP10-9P60411 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRTAP10-9P60411 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KRTAP10-9P60411 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRTAP10-9P60411 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KRTAP10-9P60411 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
KRTAP10-9P60411 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRTAP10-9P60411 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRTAP10-9P60411 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRTAP10-9P60411 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KRTAP10-9P60411 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms