Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUP107P57740 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUP107P57740 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUP107P57740 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUP107P57740 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUP107P57740 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUP107P57740 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUP107P57740 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUP107P57740 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUP107P57740 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUP107P57740 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUP107P57740 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUP107P57740 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUP107P57740 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUP107P57740 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUP107P57740 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUP107P57740 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUP107P57740 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUP107P57740 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
NUP107P57740 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUP107P57740 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUP107P57740 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUP107P57740 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUP107P57740 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP107P57740 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUP107P57740 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUP107P57740 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUP107P57740 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUP107P57740 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUP107P57740 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUP107P57740 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP107P57740 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP107P57740 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP107P57740 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP107P57740 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUP107P57740 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUP107P57740 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP107P57740 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUP107P57740 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUP107P57740 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP107P57740 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUP107P57740 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUP107P57740 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUP107P57740 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUP107P57740 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUP107P57740 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUP107P57740 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NUP107P57740 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUP107P57740 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP107P57740 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP107P57740 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NUP107P57740 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUP107P57740 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUP107P57740 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NUP107P57740 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NUP107P57740 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUP107P57740 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUP107P57740 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUP107P57740 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP107P57740 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP107P57740 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP107P57740 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP107P57740 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP107P57740 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUP107P57740 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUP107P57740 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP107P57740 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP107P57740 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NUP107P57740 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP107P57740 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP107P57740 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP107P57740 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP107P57740 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NUP107P57740 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NUP107P57740 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NUP107P57740 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUP107P57740 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NUP107P57740 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP107P57740 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NUP107P57740 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP107P57740 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP107P57740 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NUP107P57740 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NUP107P57740 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP107P57740 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP107P57740 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP107P57740 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP107P57740 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NUP107P57740 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP107P57740 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP107P57740 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NUP107P57740 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP107P57740 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NUP107P57740 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP107P57740 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP107P57740 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NUP107P57740 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP107P57740 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP107P57740 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NUP107P57740 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms