Protein–RNA interactions for Protein: P57723

PCBP4, Poly(rC)-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP4P57723 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PCBP4P57723 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PCBP4P57723 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCBP4P57723 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PCBP4P57723 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PCBP4P57723 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PCBP4P57723 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PCBP4P57723 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PCBP4P57723 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PCBP4P57723 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCBP4P57723 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCBP4P57723 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCBP4P57723 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PCBP4P57723 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCBP4P57723 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCBP4P57723 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PCBP4P57723 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCBP4P57723 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PCBP4P57723 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCBP4P57723 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCBP4P57723 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PCBP4P57723 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PCBP4P57723 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PCBP4P57723 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PCBP4P57723 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PCBP4P57723 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PCBP4P57723 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PCBP4P57723 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PCBP4P57723 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PCBP4P57723 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PCBP4P57723 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PCBP4P57723 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PCBP4P57723 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PCBP4P57723 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PCBP4P57723 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PCBP4P57723 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PCBP4P57723 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PCBP4P57723 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PCBP4P57723 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PCBP4P57723 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PCBP4P57723 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PCBP4P57723 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCBP4P57723 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCBP4P57723 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PCBP4P57723 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PCBP4P57723 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PCBP4P57723 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PCBP4P57723 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PCBP4P57723 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PCBP4P57723 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PCBP4P57723 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PCBP4P57723 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCBP4P57723 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCBP4P57723 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCBP4P57723 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCBP4P57723 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCBP4P57723 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PCBP4P57723 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PCBP4P57723 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PCBP4P57723 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCBP4P57723 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCBP4P57723 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCBP4P57723 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCBP4P57723 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCBP4P57723 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCBP4P57723 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCBP4P57723 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCBP4P57723 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCBP4P57723 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCBP4P57723 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCBP4P57723 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCBP4P57723 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PCBP4P57723 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCBP4P57723 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCBP4P57723 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCBP4P57723 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCBP4P57723 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCBP4P57723 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCBP4P57723 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCBP4P57723 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCBP4P57723 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCBP4P57723 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCBP4P57723 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCBP4P57723 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCBP4P57723 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCBP4P57723 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCBP4P57723 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCBP4P57723 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCBP4P57723 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCBP4P57723 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCBP4P57723 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCBP4P57723 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCBP4P57723 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCBP4P57723 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCBP4P57723 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCBP4P57723 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCBP4P57723 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCBP4P57723 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCBP4P57723 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCBP4P57723 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms