Protein–RNA interactions for Protein: P55809

OXCT1, Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OXCT1P55809 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
OXCT1P55809 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
OXCT1P55809 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
OXCT1P55809 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
OXCT1P55809 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
OXCT1P55809 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
OXCT1P55809 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
OXCT1P55809 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
OXCT1P55809 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
OXCT1P55809 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
OXCT1P55809 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
OXCT1P55809 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
OXCT1P55809 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
OXCT1P55809 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
OXCT1P55809 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
OXCT1P55809 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
OXCT1P55809 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
OXCT1P55809 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
OXCT1P55809 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
OXCT1P55809 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
OXCT1P55809 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
OXCT1P55809 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
OXCT1P55809 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
OXCT1P55809 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
OXCT1P55809 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
OXCT1P55809 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
OXCT1P55809 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
OXCT1P55809 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
OXCT1P55809 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
OXCT1P55809 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
OXCT1P55809 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
OXCT1P55809 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
OXCT1P55809 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
OXCT1P55809 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
OXCT1P55809 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
OXCT1P55809 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
OXCT1P55809 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
OXCT1P55809 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
OXCT1P55809 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
OXCT1P55809 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
OXCT1P55809 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
OXCT1P55809 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
OXCT1P55809 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
OXCT1P55809 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
OXCT1P55809 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
OXCT1P55809 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
OXCT1P55809 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
OXCT1P55809 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
OXCT1P55809 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
OXCT1P55809 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
OXCT1P55809 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
OXCT1P55809 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
OXCT1P55809 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
OXCT1P55809 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
OXCT1P55809 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
OXCT1P55809 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
OXCT1P55809 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
OXCT1P55809 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
OXCT1P55809 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
OXCT1P55809 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
OXCT1P55809 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
OXCT1P55809 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
OXCT1P55809 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
OXCT1P55809 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
OXCT1P55809 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
OXCT1P55809 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
OXCT1P55809 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
OXCT1P55809 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
OXCT1P55809 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
OXCT1P55809 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
OXCT1P55809 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
OXCT1P55809 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
OXCT1P55809 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
OXCT1P55809 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
OXCT1P55809 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
OXCT1P55809 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
OXCT1P55809 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
OXCT1P55809 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
OXCT1P55809 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
OXCT1P55809 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
OXCT1P55809 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
OXCT1P55809 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
OXCT1P55809 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
OXCT1P55809 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
OXCT1P55809 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
OXCT1P55809 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
OXCT1P55809 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
OXCT1P55809 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
OXCT1P55809 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
OXCT1P55809 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
OXCT1P55809 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
OXCT1P55809 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
OXCT1P55809 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
OXCT1P55809 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
OXCT1P55809 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
OXCT1P55809 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
OXCT1P55809 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
OXCT1P55809 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
OXCT1P55809 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
OXCT1P55809 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms