Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CCL23P55773 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CCL23P55773 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CCL23P55773 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CCL23P55773 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CCL23P55773 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CCL23P55773 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CCL23P55773 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CCL23P55773 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CCL23P55773 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCL23P55773 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
CCL23P55773 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CCL23P55773 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCL23P55773 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCL23P55773 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CCL23P55773 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CCL23P55773 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCL23P55773 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CCL23P55773 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CCL23P55773 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CCL23P55773 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CCL23P55773 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CCL23P55773 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CCL23P55773 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CCL23P55773 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CCL23P55773 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CCL23P55773 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CCL23P55773 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CCL23P55773 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CCL23P55773 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
CCL23P55773 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CCL23P55773 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CCL23P55773 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.11■■■□□ 2.41
CCL23P55773 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CCL23P55773 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CCL23P55773 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CCL23P55773 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
CCL23P55773 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CCL23P55773 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCL23P55773 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CCL23P55773 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CCL23P55773 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCL23P55773 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCL23P55773 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CCL23P55773 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CCL23P55773 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CCL23P55773 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCL23P55773 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCL23P55773 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCL23P55773 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CCL23P55773 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CCL23P55773 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CCL23P55773 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CCL23P55773 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
CCL23P55773 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
CCL23P55773 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCL23P55773 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CCL23P55773 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CCL23P55773 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
CCL23P55773 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
CCL23P55773 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CCL23P55773 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCL23P55773 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CCL23P55773 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
CCL23P55773 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCL23P55773 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCL23P55773 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCL23P55773 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCL23P55773 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCL23P55773 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCL23P55773 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCL23P55773 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCL23P55773 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCL23P55773 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCL23P55773 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCL23P55773 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCL23P55773 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCL23P55773 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCL23P55773 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCL23P55773 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
CCL23P55773 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCL23P55773 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
CCL23P55773 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCL23P55773 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
CCL23P55773 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCL23P55773 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
CCL23P55773 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCL23P55773 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CCL23P55773 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCL23P55773 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
CCL23P55773 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCL23P55773 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CCL23P55773 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCL23P55773 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCL23P55773 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCL23P55773 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCL23P55773 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCL23P55773 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
CCL23P55773 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CCL23P55773 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.7 ms