Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
BRCA2P51587 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
BRCA2P51587 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC31.35■■■□□ 2.61
BRCA2P51587 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
BRCA2P51587 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
BRCA2P51587 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
BRCA2P51587 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
BRCA2P51587 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
BRCA2P51587 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
BRCA2P51587 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
BRCA2P51587 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
BRCA2P51587 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
BRCA2P51587 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC31.28■■■□□ 2.6
BRCA2P51587 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
BRCA2P51587 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
BRCA2P51587 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
BRCA2P51587 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
BRCA2P51587 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
BRCA2P51587 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
BRCA2P51587 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
BRCA2P51587 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
BRCA2P51587 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
BRCA2P51587 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
BRCA2P51587 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
BRCA2P51587 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
BRCA2P51587 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
BRCA2P51587 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.2■■■□□ 2.58
BRCA2P51587 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
BRCA2P51587 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
BRCA2P51587 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
BRCA2P51587 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
BRCA2P51587 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
BRCA2P51587 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
BRCA2P51587 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
BRCA2P51587 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
BRCA2P51587 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
BRCA2P51587 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
BRCA2P51587 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
BRCA2P51587 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
BRCA2P51587 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
BRCA2P51587 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
BRCA2P51587 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
BRCA2P51587 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
BRCA2P51587 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
BRCA2P51587 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
BRCA2P51587 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
BRCA2P51587 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
BRCA2P51587 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
BRCA2P51587 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC31.08■■■□□ 2.57
BRCA2P51587 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
BRCA2P51587 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
BRCA2P51587 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
BRCA2P51587 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
BRCA2P51587 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
BRCA2P51587 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
BRCA2P51587 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
BRCA2P51587 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
BRCA2P51587 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
BRCA2P51587 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
BRCA2P51587 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
BRCA2P51587 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
BRCA2P51587 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.56
BRCA2P51587 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
BRCA2P51587 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
BRCA2P51587 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
BRCA2P51587 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
BRCA2P51587 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
BRCA2P51587 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
BRCA2P51587 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
BRCA2P51587 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
BRCA2P51587 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
BRCA2P51587 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
BRCA2P51587 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
BRCA2P51587 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
BRCA2P51587 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
BRCA2P51587 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
BRCA2P51587 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
BRCA2P51587 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
BRCA2P51587 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
BRCA2P51587 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
BRCA2P51587 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
BRCA2P51587 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC30.87■■■□□ 2.53
BRCA2P51587 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
BRCA2P51587 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
BRCA2P51587 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
BRCA2P51587 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
BRCA2P51587 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
BRCA2P51587 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
BRCA2P51587 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
BRCA2P51587 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
BRCA2P51587 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
BRCA2P51587 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
BRCA2P51587 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
BRCA2P51587 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
BRCA2P51587 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
BRCA2P51587 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
BRCA2P51587 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
BRCA2P51587 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
BRCA2P51587 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
BRCA2P51587 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms