Protein–RNA interactions for Protein: P51159

RAB27A, Ras-related protein Rab-27A, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB27AP51159 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RAB27AP51159 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RAB27AP51159 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RAB27AP51159 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
RAB27AP51159 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RAB27AP51159 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RAB27AP51159 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RAB27AP51159 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RAB27AP51159 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RAB27AP51159 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RAB27AP51159 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RAB27AP51159 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RAB27AP51159 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RAB27AP51159 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RAB27AP51159 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
RAB27AP51159 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RAB27AP51159 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RAB27AP51159 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RAB27AP51159 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RAB27AP51159 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RAB27AP51159 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RAB27AP51159 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RAB27AP51159 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RAB27AP51159 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RAB27AP51159 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RAB27AP51159 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RAB27AP51159 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RAB27AP51159 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RAB27AP51159 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RAB27AP51159 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RAB27AP51159 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RAB27AP51159 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RAB27AP51159 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RAB27AP51159 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RAB27AP51159 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RAB27AP51159 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RAB27AP51159 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RAB27AP51159 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RAB27AP51159 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RAB27AP51159 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RAB27AP51159 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RAB27AP51159 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RAB27AP51159 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RAB27AP51159 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RAB27AP51159 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RAB27AP51159 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RAB27AP51159 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RAB27AP51159 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RAB27AP51159 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RAB27AP51159 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RAB27AP51159 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RAB27AP51159 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RAB27AP51159 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RAB27AP51159 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RAB27AP51159 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RAB27AP51159 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RAB27AP51159 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RAB27AP51159 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RAB27AP51159 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RAB27AP51159 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RAB27AP51159 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
RAB27AP51159 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RAB27AP51159 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RAB27AP51159 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
RAB27AP51159 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RAB27AP51159 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RAB27AP51159 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RAB27AP51159 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RAB27AP51159 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RAB27AP51159 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RAB27AP51159 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RAB27AP51159 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RAB27AP51159 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RAB27AP51159 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RAB27AP51159 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RAB27AP51159 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RAB27AP51159 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RAB27AP51159 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RAB27AP51159 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
RAB27AP51159 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RAB27AP51159 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RAB27AP51159 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RAB27AP51159 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
RAB27AP51159 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RAB27AP51159 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RAB27AP51159 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
RAB27AP51159 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RAB27AP51159 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RAB27AP51159 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
RAB27AP51159 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RAB27AP51159 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RAB27AP51159 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RAB27AP51159 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RAB27AP51159 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RAB27AP51159 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RAB27AP51159 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RAB27AP51159 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RAB27AP51159 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RAB27AP51159 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RAB27AP51159 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms