Protein–RNA interactions for Protein: P49411

TUFM, Elongation factor Tu, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFMP49411 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TUFMP49411 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TUFMP49411 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TUFMP49411 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TUFMP49411 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TUFMP49411 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TUFMP49411 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TUFMP49411 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
TUFMP49411 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TUFMP49411 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TUFMP49411 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TUFMP49411 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TUFMP49411 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TUFMP49411 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
TUFMP49411 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TUFMP49411 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TUFMP49411 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TUFMP49411 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TUFMP49411 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TUFMP49411 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TUFMP49411 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TUFMP49411 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TUFMP49411 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
TUFMP49411 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TUFMP49411 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TUFMP49411 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TUFMP49411 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TUFMP49411 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TUFMP49411 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TUFMP49411 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TUFMP49411 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TUFMP49411 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TUFMP49411 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TUFMP49411 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TUFMP49411 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TUFMP49411 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
TUFMP49411 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TUFMP49411 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TUFMP49411 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TUFMP49411 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TUFMP49411 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TUFMP49411 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TUFMP49411 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TUFMP49411 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TUFMP49411 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TUFMP49411 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TUFMP49411 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TUFMP49411 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TUFMP49411 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TUFMP49411 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TUFMP49411 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TUFMP49411 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TUFMP49411 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TUFMP49411 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TUFMP49411 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TUFMP49411 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TUFMP49411 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TUFMP49411 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TUFMP49411 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TUFMP49411 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TUFMP49411 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TUFMP49411 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TUFMP49411 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TUFMP49411 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TUFMP49411 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
TUFMP49411 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TUFMP49411 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TUFMP49411 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TUFMP49411 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TUFMP49411 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TUFMP49411 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TUFMP49411 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TUFMP49411 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TUFMP49411 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TUFMP49411 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TUFMP49411 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
TUFMP49411 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TUFMP49411 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TUFMP49411 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TUFMP49411 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TUFMP49411 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TUFMP49411 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TUFMP49411 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TUFMP49411 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TUFMP49411 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TUFMP49411 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TUFMP49411 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TUFMP49411 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TUFMP49411 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TUFMP49411 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TUFMP49411 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TUFMP49411 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TUFMP49411 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TUFMP49411 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TUFMP49411 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TUFMP49411 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TUFMP49411 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TUFMP49411 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TUFMP49411 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
TUFMP49411 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms