Protein–RNA interactions for Protein: P49247

RPIA, Ribose-5-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPIAP49247 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPIAP49247 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
RPIAP49247 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
RPIAP49247 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
RPIAP49247 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RPIAP49247 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RPIAP49247 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RPIAP49247 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RPIAP49247 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RPIAP49247 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RPIAP49247 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RPIAP49247 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RPIAP49247 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RPIAP49247 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RPIAP49247 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RPIAP49247 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RPIAP49247 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RPIAP49247 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RPIAP49247 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RPIAP49247 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RPIAP49247 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RPIAP49247 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RPIAP49247 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RPIAP49247 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RPIAP49247 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RPIAP49247 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
RPIAP49247 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RPIAP49247 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RPIAP49247 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RPIAP49247 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RPIAP49247 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RPIAP49247 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RPIAP49247 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RPIAP49247 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPIAP49247 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPIAP49247 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RPIAP49247 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RPIAP49247 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RPIAP49247 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RPIAP49247 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RPIAP49247 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RPIAP49247 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
RPIAP49247 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RPIAP49247 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RPIAP49247 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RPIAP49247 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
RPIAP49247 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RPIAP49247 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RPIAP49247 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RPIAP49247 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPIAP49247 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPIAP49247 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPIAP49247 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPIAP49247 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPIAP49247 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPIAP49247 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPIAP49247 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RPIAP49247 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RPIAP49247 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RPIAP49247 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
RPIAP49247 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RPIAP49247 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
RPIAP49247 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPIAP49247 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPIAP49247 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RPIAP49247 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RPIAP49247 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RPIAP49247 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
RPIAP49247 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RPIAP49247 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RPIAP49247 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RPIAP49247 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RPIAP49247 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RPIAP49247 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
RPIAP49247 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPIAP49247 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPIAP49247 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
RPIAP49247 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RPIAP49247 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RPIAP49247 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RPIAP49247 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RPIAP49247 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
RPIAP49247 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RPIAP49247 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RPIAP49247 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RPIAP49247 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RPIAP49247 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
RPIAP49247 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RPIAP49247 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RPIAP49247 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RPIAP49247 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RPIAP49247 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RPIAP49247 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RPIAP49247 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RPIAP49247 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RPIAP49247 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RPIAP49247 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RPIAP49247 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
RPIAP49247 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RPIAP49247 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms