Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHRNA4P43681 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHRNA4P43681 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CHRNA4P43681 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHRNA4P43681 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHRNA4P43681 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHRNA4P43681 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CHRNA4P43681 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHRNA4P43681 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHRNA4P43681 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHRNA4P43681 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHRNA4P43681 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CHRNA4P43681 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHRNA4P43681 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHRNA4P43681 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHRNA4P43681 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHRNA4P43681 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHRNA4P43681 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHRNA4P43681 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHRNA4P43681 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHRNA4P43681 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHRNA4P43681 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHRNA4P43681 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHRNA4P43681 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHRNA4P43681 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHRNA4P43681 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHRNA4P43681 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHRNA4P43681 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHRNA4P43681 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CHRNA4P43681 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHRNA4P43681 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHRNA4P43681 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHRNA4P43681 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHRNA4P43681 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHRNA4P43681 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CHRNA4P43681 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHRNA4P43681 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CHRNA4P43681 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHRNA4P43681 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHRNA4P43681 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHRNA4P43681 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHRNA4P43681 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHRNA4P43681 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHRNA4P43681 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHRNA4P43681 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CHRNA4P43681 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHRNA4P43681 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CHRNA4P43681 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHRNA4P43681 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHRNA4P43681 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHRNA4P43681 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHRNA4P43681 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHRNA4P43681 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHRNA4P43681 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHRNA4P43681 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHRNA4P43681 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHRNA4P43681 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHRNA4P43681 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHRNA4P43681 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHRNA4P43681 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHRNA4P43681 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CHRNA4P43681 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHRNA4P43681 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHRNA4P43681 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHRNA4P43681 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHRNA4P43681 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CHRNA4P43681 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHRNA4P43681 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHRNA4P43681 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHRNA4P43681 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHRNA4P43681 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHRNA4P43681 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHRNA4P43681 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHRNA4P43681 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHRNA4P43681 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHRNA4P43681 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHRNA4P43681 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CHRNA4P43681 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHRNA4P43681 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHRNA4P43681 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHRNA4P43681 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHRNA4P43681 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHRNA4P43681 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHRNA4P43681 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHRNA4P43681 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHRNA4P43681 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHRNA4P43681 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHRNA4P43681 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHRNA4P43681 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CHRNA4P43681 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHRNA4P43681 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CHRNA4P43681 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHRNA4P43681 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHRNA4P43681 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CHRNA4P43681 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHRNA4P43681 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHRNA4P43681 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHRNA4P43681 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHRNA4P43681 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHRNA4P43681 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms