Protein–RNA interactions for Protein: P35749

MYH11, Myosin-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,972 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH11P35749 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
MYH11P35749 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
MYH11P35749 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
MYH11P35749 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
MYH11P35749 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
MYH11P35749 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
MYH11P35749 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
MYH11P35749 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
MYH11P35749 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
MYH11P35749 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
MYH11P35749 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
MYH11P35749 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
MYH11P35749 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
MYH11P35749 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
MYH11P35749 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
MYH11P35749 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
MYH11P35749 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.4
MYH11P35749 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
MYH11P35749 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30■■■□□ 2.39
MYH11P35749 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
MYH11P35749 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
MYH11P35749 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
MYH11P35749 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
MYH11P35749 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
MYH11P35749 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
MYH11P35749 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
MYH11P35749 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
MYH11P35749 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
MYH11P35749 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
MYH11P35749 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
MYH11P35749 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
MYH11P35749 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
MYH11P35749 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
MYH11P35749 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
MYH11P35749 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
MYH11P35749 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
MYH11P35749 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
MYH11P35749 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
MYH11P35749 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
MYH11P35749 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
MYH11P35749 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
MYH11P35749 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
MYH11P35749 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
MYH11P35749 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
MYH11P35749 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
MYH11P35749 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
MYH11P35749 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
MYH11P35749 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
MYH11P35749 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
MYH11P35749 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
MYH11P35749 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
MYH11P35749 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
MYH11P35749 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
MYH11P35749 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
MYH11P35749 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
MYH11P35749 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
MYH11P35749 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
MYH11P35749 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
MYH11P35749 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
MYH11P35749 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
MYH11P35749 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
MYH11P35749 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
MYH11P35749 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
MYH11P35749 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
MYH11P35749 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
MYH11P35749 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
MYH11P35749 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
MYH11P35749 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
MYH11P35749 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
MYH11P35749 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
MYH11P35749 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
MYH11P35749 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
MYH11P35749 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
MYH11P35749 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
MYH11P35749 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
MYH11P35749 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
MYH11P35749 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
MYH11P35749 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
MYH11P35749 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
MYH11P35749 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
MYH11P35749 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
MYH11P35749 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
MYH11P35749 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
MYH11P35749 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
MYH11P35749 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
MYH11P35749 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
MYH11P35749 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
MYH11P35749 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
MYH11P35749 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
MYH11P35749 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
MYH11P35749 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
MYH11P35749 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
MYH11P35749 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
MYH11P35749 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
MYH11P35749 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
MYH11P35749 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
MYH11P35749 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
MYH11P35749 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
MYH11P35749 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
MYH11P35749 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms