Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CASQ1P31415 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CASQ1P31415 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CASQ1P31415 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CASQ1P31415 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CASQ1P31415 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CASQ1P31415 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CASQ1P31415 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CASQ1P31415 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
CASQ1P31415 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CASQ1P31415 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CASQ1P31415 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CASQ1P31415 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CASQ1P31415 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CASQ1P31415 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CASQ1P31415 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CASQ1P31415 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CASQ1P31415 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CASQ1P31415 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CASQ1P31415 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CASQ1P31415 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CASQ1P31415 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CASQ1P31415 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CASQ1P31415 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CASQ1P31415 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CASQ1P31415 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CASQ1P31415 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CASQ1P31415 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CASQ1P31415 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CASQ1P31415 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CASQ1P31415 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CASQ1P31415 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CASQ1P31415 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CASQ1P31415 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CASQ1P31415 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CASQ1P31415 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CASQ1P31415 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CASQ1P31415 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CASQ1P31415 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CASQ1P31415 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CASQ1P31415 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CASQ1P31415 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CASQ1P31415 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CASQ1P31415 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CASQ1P31415 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CASQ1P31415 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CASQ1P31415 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CASQ1P31415 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CASQ1P31415 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CASQ1P31415 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CASQ1P31415 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CASQ1P31415 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CASQ1P31415 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CASQ1P31415 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CASQ1P31415 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CASQ1P31415 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CASQ1P31415 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CASQ1P31415 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CASQ1P31415 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CASQ1P31415 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CASQ1P31415 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CASQ1P31415 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CASQ1P31415 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CASQ1P31415 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CASQ1P31415 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CASQ1P31415 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CASQ1P31415 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CASQ1P31415 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CASQ1P31415 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CASQ1P31415 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CASQ1P31415 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CASQ1P31415 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CASQ1P31415 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CASQ1P31415 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CASQ1P31415 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CASQ1P31415 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CASQ1P31415 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CASQ1P31415 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CASQ1P31415 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CASQ1P31415 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CASQ1P31415 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CASQ1P31415 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CASQ1P31415 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CASQ1P31415 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CASQ1P31415 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CASQ1P31415 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CASQ1P31415 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CASQ1P31415 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CASQ1P31415 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CASQ1P31415 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CASQ1P31415 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CASQ1P31415 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CASQ1P31415 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CASQ1P31415 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CASQ1P31415 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CASQ1P31415 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CASQ1P31415 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CASQ1P31415 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CASQ1P31415 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CASQ1P31415 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms