Protein–RNA interactions for Protein: P29400

COL4A5, Collagen alpha-5(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A5P29400 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
COL4A5P29400 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
COL4A5P29400 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
COL4A5P29400 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
COL4A5P29400 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.72■■■□□ 2.99
COL4A5P29400 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC33.72■■■□□ 2.99
COL4A5P29400 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC33.72■■■□□ 2.99
COL4A5P29400 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
COL4A5P29400 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
COL4A5P29400 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
COL4A5P29400 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
COL4A5P29400 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
COL4A5P29400 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
COL4A5P29400 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
COL4A5P29400 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
COL4A5P29400 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
COL4A5P29400 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
COL4A5P29400 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
COL4A5P29400 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
COL4A5P29400 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
COL4A5P29400 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
COL4A5P29400 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
COL4A5P29400 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC33.58■■■□□ 2.97
COL4A5P29400 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
COL4A5P29400 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
COL4A5P29400 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
COL4A5P29400 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
COL4A5P29400 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
COL4A5P29400 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
COL4A5P29400 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.54■■■□□ 2.96
COL4A5P29400 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC33.53■■■□□ 2.96
COL4A5P29400 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
COL4A5P29400 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
COL4A5P29400 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
COL4A5P29400 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
COL4A5P29400 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
COL4A5P29400 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
COL4A5P29400 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
COL4A5P29400 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
COL4A5P29400 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
COL4A5P29400 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
COL4A5P29400 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
COL4A5P29400 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
COL4A5P29400 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
COL4A5P29400 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
COL4A5P29400 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
COL4A5P29400 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
COL4A5P29400 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
COL4A5P29400 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
COL4A5P29400 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
COL4A5P29400 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
COL4A5P29400 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
COL4A5P29400 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
COL4A5P29400 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
COL4A5P29400 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
COL4A5P29400 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
COL4A5P29400 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
COL4A5P29400 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
COL4A5P29400 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
COL4A5P29400 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
COL4A5P29400 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
COL4A5P29400 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
COL4A5P29400 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
COL4A5P29400 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
COL4A5P29400 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
COL4A5P29400 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
COL4A5P29400 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
COL4A5P29400 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC33.25■■■□□ 2.91
COL4A5P29400 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
COL4A5P29400 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
COL4A5P29400 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
COL4A5P29400 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
COL4A5P29400 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
COL4A5P29400 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
COL4A5P29400 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
COL4A5P29400 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
COL4A5P29400 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
COL4A5P29400 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
COL4A5P29400 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
COL4A5P29400 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
COL4A5P29400 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
COL4A5P29400 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
COL4A5P29400 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC33.17■■■□□ 2.9
COL4A5P29400 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
COL4A5P29400 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
COL4A5P29400 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
COL4A5P29400 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
COL4A5P29400 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
COL4A5P29400 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
COL4A5P29400 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
COL4A5P29400 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
COL4A5P29400 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
COL4A5P29400 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
COL4A5P29400 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
COL4A5P29400 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
COL4A5P29400 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
COL4A5P29400 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
COL4A5P29400 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC33.03■■■□□ 2.88
COL4A5P29400 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
COL4A5P29400 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms