Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
EPHA1P21709 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPHA1P21709 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EPHA1P21709 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EPHA1P21709 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPHA1P21709 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPHA1P21709 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPHA1P21709 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPHA1P21709 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EPHA1P21709 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPHA1P21709 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPHA1P21709 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPHA1P21709 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPHA1P21709 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EPHA1P21709 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EPHA1P21709 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
EPHA1P21709 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHA1P21709 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EPHA1P21709 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPHA1P21709 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EPHA1P21709 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHA1P21709 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EPHA1P21709 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPHA1P21709 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPHA1P21709 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHA1P21709 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHA1P21709 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPHA1P21709 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPHA1P21709 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPHA1P21709 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPHA1P21709 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPHA1P21709 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPHA1P21709 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPHA1P21709 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPHA1P21709 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPHA1P21709 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPHA1P21709 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPHA1P21709 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPHA1P21709 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
EPHA1P21709 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHA1P21709 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHA1P21709 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHA1P21709 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHA1P21709 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHA1P21709 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHA1P21709 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHA1P21709 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPHA1P21709 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EPHA1P21709 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHA1P21709 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHA1P21709 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHA1P21709 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EPHA1P21709 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EPHA1P21709 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHA1P21709 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHA1P21709 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHA1P21709 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHA1P21709 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHA1P21709 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHA1P21709 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHA1P21709 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHA1P21709 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHA1P21709 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHA1P21709 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHA1P21709 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
EPHA1P21709 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPHA1P21709 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPHA1P21709 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPHA1P21709 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPHA1P21709 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPHA1P21709 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPHA1P21709 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPHA1P21709 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPHA1P21709 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPHA1P21709 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPHA1P21709 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPHA1P21709 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPHA1P21709 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPHA1P21709 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPHA1P21709 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPHA1P21709 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPHA1P21709 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHA1P21709 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHA1P21709 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHA1P21709 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EPHA1P21709 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EPHA1P21709 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EPHA1P21709 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPHA1P21709 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPHA1P21709 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EPHA1P21709 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EPHA1P21709 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EPHA1P21709 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EPHA1P21709 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EPHA1P21709 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EPHA1P21709 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
EPHA1P21709 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
EPHA1P21709 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EPHA1P21709 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EPHA1P21709 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms