Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ITGB6P18564 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ITGB6P18564 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ITGB6P18564 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ITGB6P18564 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGB6P18564 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGB6P18564 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ITGB6P18564 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
ITGB6P18564 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ITGB6P18564 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ITGB6P18564 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGB6P18564 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGB6P18564 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGB6P18564 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGB6P18564 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ITGB6P18564 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ITGB6P18564 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ITGB6P18564 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ITGB6P18564 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ITGB6P18564 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ITGB6P18564 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ITGB6P18564 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ITGB6P18564 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ITGB6P18564 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ITGB6P18564 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ITGB6P18564 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ITGB6P18564 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ITGB6P18564 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ITGB6P18564 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ITGB6P18564 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ITGB6P18564 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITGB6P18564 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITGB6P18564 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ITGB6P18564 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ITGB6P18564 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ITGB6P18564 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITGB6P18564 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ITGB6P18564 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITGB6P18564 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITGB6P18564 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITGB6P18564 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITGB6P18564 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITGB6P18564 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ITGB6P18564 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ITGB6P18564 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ITGB6P18564 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITGB6P18564 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ITGB6P18564 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGB6P18564 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGB6P18564 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITGB6P18564 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGB6P18564 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGB6P18564 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGB6P18564 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGB6P18564 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGB6P18564 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGB6P18564 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ITGB6P18564 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ITGB6P18564 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ITGB6P18564 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGB6P18564 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ITGB6P18564 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
ITGB6P18564 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGB6P18564 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ITGB6P18564 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ITGB6P18564 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGB6P18564 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ITGB6P18564 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGB6P18564 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGB6P18564 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ITGB6P18564 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGB6P18564 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGB6P18564 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ITGB6P18564 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ITGB6P18564 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGB6P18564 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ITGB6P18564 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ITGB6P18564 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ITGB6P18564 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ITGB6P18564 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ITGB6P18564 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ITGB6P18564 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ITGB6P18564 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ITGB6P18564 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
ITGB6P18564 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITGB6P18564 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITGB6P18564 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ITGB6P18564 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGB6P18564 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGB6P18564 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGB6P18564 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ITGB6P18564 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ITGB6P18564 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGB6P18564 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGB6P18564 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGB6P18564 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ITGB6P18564 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITGB6P18564 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITGB6P18564 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ITGB6P18564 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms